cz
en

Pro studenty

Laboratoř Antibiotické rezistence a mikrobiální metabolomiky

Pro studenty

Nabízíme možnost vypracování bakalářských/diplomových/disertačních prací v oblasti mikrobiologie, biochemie a proteinového inženýrství. Pokud se chcete stát členem našeho týmu jako student magisterského nebo doktorského studia nebo postdoktorand, kontaktujte nás a zašlete nám životopis a motivační dopis.

PhD program

Jak začít, pokud chci na Mikrobiologickém ústavu vypracovat bakalářskou, diplomovou nebo disertační práci?

Nejlepším startovním bodem je oslovit laboratoř zabývající se výzkumem, na kterém byste se chtěl/a podílet. Můžete začít v sekci vypsaných témat týká se především disertačních prací) s nabídkami laboratoří, které aktuálně hledají studenty. Nenechte se ale odradit, pokud nenajdete žádnou pro Vás vhodnou nabídku. Projděte si informace o jednotlivých laboratořích na webu Mikrobiologického ústavu, a pokud Vás vědecká tématika některé z laboratoří zaujme, neváhejte kontaktovat přímo vedoucího laboratoře nebo jiného pracovníka. S ním se domluvíte na dalším postupu.

Stačí domluvit se s laboratoří Mikrobiologického ústavu?

Pro vypracování jakékoli formální studentské práce musíte být (nebo se stát) studentem/studentkou některé z českých (případně i zahraničních) univerzit. Konkrétní dohoda mezi univerzitou a Mikrobiologických ústavem je individuální – zaleží na univerzitě, typu studentské práce, zda již studujete nebo teprve plánujete studium zahájit. O vhodném postupu se proto poraďte přímo s vedoucím Vámi vybrané laboratoře. Nezapomeňte, že zahájení studia na univerzitě obvykle předchází přijímací řízení, ke kterému se musíte včas přihlásit.

Mohu se zapojit do výzkumu i jako student/ka střední školy?

Ano, je to možné. Kontaktujte laboratoř, jejíž výzkum Vás zajímá a domluvte se na konkrétní možnosti spolupráce. Vynikající příležitostí jsou také vědecké stáže na pracovištích Akademie věd v rámci projektu Otevřená věda. Stáže jsou cíleny přímo na středoškolské a vysokoškolské studenty/studentky a mohou být startovní pozicí ať už pro projekt Středoškolské odborné činnosti nebo pro Vaši budoucí bakalářskou nebo diplomovou práci. Více informací naleznete na webu www.otevrenaveda.cz

Budu mít jako student/ka na Mikrobiologickém ústavu nějaké povinnosti?

Vaše povinnosti vyplývají především z dohody s vedoucím laboratoře, ve které budete pracovat. Týká se to jak postupu na Vaší studentské práci, tak i případných jiných pracovních aktivit. Budete-li mít pracovní úvazek, jste povinni dodržovat všechny platné předpisy MBÚ, zejména docházku na pracoviště podle výše úvazku. Od studentů doktorského studia se dále očekává, že budou dle svých možností navštěvovat ústavní vědecké semináře, které probíhají v pátek dopoledne.

Jak budu finančně ohodnocen/a?

Studenti/studentky doktorského studia dostávají stipendium od svých fakult. Jejich výše je na každé fakultě různá a může záviset na ročníku, ve kterém studujete, na pedagogické a publikační aktivitě nebo na účasti na vědeckých konferencích. Úvazek na Mikrobiologickém ústavu je třeba vždy dohodnout s vedoucím Vaší laboratoře – jeho výše závisí na možnostech laboratoře a konkrétní domluvě. Studenti doktorského studia obvykle získají úvazek 50-100%, studenti bakalářského a magisterského studia vzhledem k omezené časové kapacitě pak nejčastěji symbolický úvazek 5-20%.

Čekají mě jako VŠ studenta/studentku na Mikrobiologickém ústavu nějaké další benefity?

Největším benefitem je bezesporu možnost vypracovat studentskou (bakalářskou, magisterskou nebo doktorskou) práci v moderní vědecké instituci a optimálně tak nastartovat Vaši profesní kariéru. Kromě toho na Vás ovšem čeká celá řada dalších benefitů:

Motivační odměna za vědecký výkon a publikační aktivitu

V případě, že se výsledky Vaší práce v laboratoři podaří uveřejnit v publikaci, kde budete prvním autorem, bude Vám ředitelem Mikrobiologického ústavu udělena finanční prémie ve výši impaktního faktoru vědeckého časopisu vynásobeného částkou 1000,- Kč (výše impaktních faktorů se podle prestiže časopisu nejčastěji pohybuje mezi 1 a 10). Pravidelně jsou odměňovány také nejlepší diplomové a dizertační práce a vědecké týmy jako celek za excelentní publikační výstupy.

Stravenky

Pokud budete mít na Mikrobiologickém ústavu pracovní úvazek, získáte nárok na stravenky PLUXEE ve výši 70,- Kč, které budou ze strany zaměstnavatele dotovány částkou 38,50 Kč. Počet stravenek bude záviset na výši Vašeho úvazku a docházky. Stravenky je možné využít jak ve dvou jídelnách krčského kampusu, tak v řadě jiných stravovacích zařízení a obchodů s potravinami.

Kurzy cizích jazyků

Jako zaměstnanec Mikrobiologického ústavu můžete absolvovat finančně velmi výhodné kurzy cizích jazyků, zejména anglického jazyka (obecná i odborná angličtina, zkouškové kurzy, kurzy češtiny pro cizince). Jazykové kurzy probíhají v centru Prahy nedaleko Masarykova nádraží (Kabinet studia jazyků Ústavu pro jazyk český AVČR, Hybernská 8/1000, 110 00 Praha 1); více informací najdete na webu www.langdpt.cas.cz. Kromě toho probíhají kurzy anglického jazyka také v krčském kampusu na Ústavu molekulární genetiky. Ty je možno navštěvovat po individuální domluvě.

Další zaměstnanecké benefity

V případě, že pracujete na Mikrobiologickém ústavu déle než 1 rok s úvazkem alespoň 50%, získáte dle Vašeho výběru nárok na jeden z následujících benefitů: (1) příspěvek zaměstnavatele k penzijnímu pojištění, (2) poukázky Flexi Pass – Pluxee, (3) Multisport karta – multisport.cz

Sportovní vyžití

V krčském kampusu je k dispozici posilovna a squash – www.img.cas.cz/dalsi-zarizeni/sportovni-zarizeni/ a venkovní hřiště s umělým povrchem (fotbal, basketbal, volejbal)

Mám nárok na ubytování, když nejsem z Prahy?

Jako vysokoškolský student si můžete zažádat o kolej dle nabídky Vaší univerzity. Řada studentů řeší svoje ubytování pronájmem soukromého bytu. Ubytování v ubytovně Mikrobiologického ústavu je primárně určeno pro zahraniční pracovníky a studentům z ČR je poskytováno jen výjimečně.

Průběžná teze

JménoZahájenoTypTitul
Mufarrah Mehboobová2023disertační práceZkoumání regulační funkce ABCF proteinů reagujících na antibiotika u bakterií produkujících antibiotika
Iva Nalezencová2023disertační práceZkoumání regulační funkce proteinů ABCF u S. aureus pomocí pokročilých technik in vivo ke studiu translace
Natálie Zárybnická2023diplomová práceHomology eukaryotických histon methyltransferáz v biosyntéze bakteriálních metabolitů: objasnění struktury a funkce
Emma Polomská2023diplomová práceRozluštění nových bioaktivních metabolitů s motivem alkylprolinu prostřednictvím exprese genového klastru a objasnění chemické struktury
Jakub Musil2022diplomová práceMechanismus regulace genové exprese řízený ribozomální ABCF ATPázou LmrC
Lucie Korbová2022diplomová práceÚloha proteinů LmbF a CcbF v biosyntéze antibiotik linkomycinu a celesticetinu a jejich potenciální aplikace v biosyntéze hybridního antibiotika celinu
Ondřej Hřebíček2022disertační práceVývoj bioinformatického softwaru pro cílenou analýzu genových shluků a jeho aplikace pro studium biosyntézy bakteriálních metabolitů s neobvyklým motivem 4-alkyl-L-prolinu
Bára Jadala2022disertační prácePřínos motivu 4-alkyl-L-prolinu pro biologickou aktivitu mikrobiálních metabolitů s odlišnými způsoby účinku
Anna Jelínková2021disertační práceLC/MS identifikace nových biomarkerů v myších gnotobiotických modelech lidských civilizačních chorob
Michaela Novotná2021disertační práceRegulace genové exprese proteinů ABCF rezistence na antibiotika a jejich role v regulaci translace
Michaela Plechatá2021disertační práceStrukturní a funkční diverzita bioaktivních specializovaných metabolitů produkovaných Actinobacteria
Lada Hanzlíková2019disertační práceTěžba genomu směrem k novým metabolitům s 4-alkyl-L-prolinovými skupinami
Magdaléna Lenartová2015disertační práceBiosyntéza pyrrolobenzodiazepinů a příbuzných přírodních sloučenin

Obhájená teze

JménoHotovoTypTitul
Eliška Mašková
2023diplomová práceÚloha ABCF ATPáz v regulaci translace u Staphylococcus aureus
 Veronika Zachovalová2023diplomová práceDetailní charakterizace SAM-dependentní methyltransferázy z biosyntézy linkomycinu na úrovni aminokyselin
 Kateřina Nováková2023diplomová práceHodnocení antimikrobiální aktivity metabolitů půdních aktinomycet proti multirezistentním bakteriálním patogenům
 Jan Kýr2023diplomová práceBuněčné faktory ovlivňující antibiotickou rezistenci proteinů ABCF
 Gioele Pecin2022diplomová práceAlternativní cesta APD produkující výhradně metabolity 3-C postranního řetězce s 4-alkyl-L-prolinem
Ondřej Hřebíček2022diplomová práceEnzymatické modifikace derivátů 4-alkyl-L-prolinu začleněné do specializovaných metabolitů Actinobacteria
Lukáš Kekrt2022bakalářská práceÚloha F 
420 -dependentních oxidoreduktáz v aktinobakteriích
Martin Kurečka2022disertační práceInterakce mezi Schistosoma spp. a jejich hostitelů na úrovni metabolomu
Jakub Lenart2021disertační práceKritická místa určující fenotyp rezistence proteinů ABC z podrodiny ARE a molekulární mechanismus jejich funkce
Šimon Vobruba2021diplomová práceStudium klíčových bodů biosyntézy linkomycinu a celesticetinu
Monika Bartalová2021diplomová práceHodnocení antimikrobiální aktivity metabolitů aktinomycet proti klinicky významným bakteriálním patogenům
Anna Jelínková2021diplomová práceVývoj metody LC-MS pro necílenou metabolomiku polárních sloučenin
Michaela Novotná2021diplomová práceMechanismus indukovatelné genové exprese proteinu rezistence Vga(A)LC ze Staphylococcus haemolyticus
Barbora Těšínská2020diplomová práceKomplexní charakterizace subgingiválního plaku – využití moderních sekvenačních metod v diagnostice a monitorování léčby onemocnění parodontu
Bianka Micka2020bakalářská práceFunkce ABCF proteinů u bakterií
Lucie Steiningerová2020disertační práceÚloha reduktáz závislých na F4222H2 v biosyntéze mikrobiálních bioaktivních metabolitů obsahujících derivát 4-alkyl-˪-prolinu
Petra Jirásková2020disertační práceBiosyntéza propylprolinovéstavební jednotky linkomycinu