Antibiotika
Antibiotická rezistence je nyní jednou z největších hrozeb pro globální zdraví, potravinovou bezpečnost a rozvoj. V naší skupině zkoumáme mechanismus rezistence vůči antibiotikům cíleným na ribozomy zprostředkované proteiny ABCF udělujícími rezistenci vůči několika skupinám klinicky významných antibakteriálních látek, např. makrolidů a linkosamidů. Se zaměřením na primární roli antibiotik a odpovídajících determinant rezistence v přirozeném prostředí zkoumáme evoluční mechanismy vedoucí od buněčné signalizace a regulačních molekul k antimikrobiální rezistenci. Lepší pochopení principů funkce ABCF antibiotické rezistence (ARE) a vývoje rezistence by mohlo poskytnout strategie pro vývoj nových zajímavých sloučenin a přístupů k překonání tohoto typu rezistence.
ABCF ATPáza LmrC ze Streptomyces lincolnensis jako regulátor
LmrC iniciuje produkci linkomycinu jako odpověď na antibiotika skupiny linkosamid, streptogramin A a pleuromutilin (LSAP) v prostředí (Koberska, mBio, 2021). Dále objasníme mechanismus, jak je signál z prostředí získáván a dále zpracováván k aktivaci biosyntézy linkomycinu
Proteiny ABCF ARE5 v S. COELICOLOR
Přestože jsou členy stejné podrodiny ARE5 ABC-F, Sco0636 a Sco6720 mají odlišné funkce. Vzhledem k tomu, že geny ARE ABC-F jsou kódovány v genomech mnoha klinicky relevantních bakteriálních druhů, je důležité určit molekulární determinanty antibiotické rezistence a antibiotické signalizační funkce a pochopit, do jaké míry představují ARE ABC-F hrozbu pro nově vzniklé vyvinuli léky zaměřené na ribozom.
Mechanismus útlumu VgaA
VgaA, který zprostředkovává rezistenci na antibiotika LSaP u stafylokoků Pochopení molekulárních detailů toho, jak se tvoří komplex zástavy ribozomů v reakci na antibiotika LSaP v různých atentuátorech, usnadní vývoj nových derivátů se zlepšenými aktivitami proti mutli-rezistentním patogenům.