Strukturní biologie a buněčné signalizace
PETERSLAB
Naši skupinu tvoří multidisciplinární tým, jehož tematické zaměření je rozděleno do dvou hlavních směrů. Skupina strukturní biologie charakterizuje strukturu proteinů nebo proteinových komplexů a studuje jejich dynamiku s využitím pokročilých technik hmotnostní spektrometrie, jmenovitě technikami nativní hmotnostní spektrometrie, vodík-deuteriové výměny, radikálového nebo chemické značení proteinů a zesíťování proteinů. Protože tato data jsou poměrně složitá a existuje jen málo komerčních řešení pro jejich interpretaci, věnuje laboratoř část svého úsilí vývoji softwaru a psaní kódu. Skupina klinické proteomiky zkoumá původ různých druhů lidských patologií od bakteriálních/virových infekcí přes diabetes až po poruchu funkce ledvin a demenci. Hlavní předností tohoto týmu je unikátní „know-how“ výroby proteinových čipů pro imunoafinitní purifikaci. Tyto proteinové čipy jsou plně kompatibilní s hmotnostně-spektrometrickou detekcí.

Zaměření výzkumu
Strukturní proteomika
Klinická diagnostika
Hmotnostní spektrometrie
Funkcionalizované povrchy pro hmotnostní spektrometrii
- imobilizace okolního iontu přistávacího proteinu
- povrchové Imunoafinitní substráty pro klinickou diagnostiku
- biochemicky aktivní destičky pro desorpční hmotnostní spektrometrii
Významné objevy, ocenění a úspěchy
Cena Vladimíra Hanuše Award 2023
2023 Zdeněk Kukačka
Fast Fluoroalkylation of Proteins Uncovers the Structure and Dynamics of Biological Macromolecules
Služby pro veřejnost a spolupráce
- Strukturní charakterizace interakce nových léčiv s jejich proteinovými cíli, validace produkce biologických terapeutik, kvantifikace mutantních forem proteinů v klinických vzorcích
- Bruker Daltonics, Nested Therapeutics, and VantAI.ai
- Yoni Haitin and Moshe Giladi, Tel Aviv University, Israel
- Daniele Fabris, University of Connecticut, Storrs, Connecticut, U.S.A.
- Charlotte Uetrecht, Centre for Structural Systems Biology, Hamburg, Germany

Naše publikace
Updating the distribution of sand flies in Hungary with implications on their biology and ecology
Salivary proteome and microbiome in pregnancy and postpartum: An exploratory study on the relation with arterial hypertension
Náš tým
Seznamte se s členy našeho týmu Laboratoře strukturní biologie a buněčné signalizace
Novák Lab