Quantitative Aspect of Bacillus subtilis ?B Regulatory Network on a Proteome Level—A Computational Simulation 2024 Laboratoř bioinformatiky Vohradský J.Biology. 2024; 13(8); 61410.3390/biology13080614
Whole proteome analysis of germinating and outgrowing Bacillus subtilis 168 2024 Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese Pospíšil J.Sax A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J.Proteomics. 2024; č. článku 240003110.1002/pmic.202400031
A new role of sigma factors in regulation of bacterial transcription 2023 Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese Pospíšil J.Schwarz M.Ziková A.Vítovská D.Hradilová M.Kolář M.Křenková A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J.Czech Chem. Soc. Symp. Series. 2023; 21(5); 210-210
?E of Streptomyces coelicolor can function both as a direct activator or repressor of transcription 2024 Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese Pospíšil J.Schwarz M.Ziková A.Vítovská D.Hradilová M.Kolář M.Křenková A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J.Communications Biology. 2024; 7(January 6); 46/10.1038/s42003-023-05716-y
Quantitative Aspect of Bacillus subtilis ?B Regulatory Network—A Computational Simulation 2022 Laboratoř bioinformatiky Vohradský J.Biology. 2022; 11(12); 1112172910.3390/biology11121729
rboAnalyzer webserver: web service for non-coding RNA characterization from NCBI BLAST output 2021 Laboratoř bioinformatiky Schwarz M.Vohradský J.Pánek J.Bioinformatics. 2021; 37(17); 2755-275610.1093/bioinformatics/btab073
Kinetic Modeling and Meta-Analysis of the Bacillus subtilis SigB Regulon during Spore Germination and Outgrowth 2021 Laboratoř bioinformatiky Vohradský J.Schwarz M.Ramaniuk O.Ruiz-Larrabeiti O.Vaňková Hausnerová V.Šanderová H.Krásný L.Microorganisms. 2021; 9(1)10.3390/microorganisms9010112
rboAnalyzer: A Software to Improve Characterization of Non-coding RNAs From Sequence Database Search Output 2020 Laboratoř bioinformatiky Schwarz M.Vohradský J.Modrák M.Pánek J.Frontiers in genetics. 2020; 11(Jul 28); 67510.3389/fgene.2020.00675
A Comparison of Protein and mRNA Expression during Development of the Soil Dwelling Prokaryote (S. coelicolor) 2020 Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese Pospíšil J.Strunin D.Ziková A.Hubálek M.Vohradský J.Proteomics. 2020; 20(14); 200003210.1002/pmic.202000032
rPredictorDB: a predictive database of individual secondary structures of RNAs and their formatted plots 2019 Laboratoř bioinformatiky Jelínek J.Hoksza D.Hajič J.Pešek J.Drozen J.Hladík T.Klimpera M.Vohradský J.Pánek J.Database - The Journal of Biological Databases and Curation. 2019; 2019(APR 25); baz04710.1093/database/baz047
DNA mapping and kinetic modeling of the HrdB regulon in Streptomyces coelicolor. 2019 Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese Šmídová K.Ziková A.Pospíšil J.Schwarz M.Bobek J.Vohradský J.Nucleic Acids Research. 2019; 47(2); 621-63310.1093/nar/gky1018
