cz
en

Laboratoř bioinformatiky   

Menu

Bioinformatika   

Laboratoř se zaměřuje jak na původní výzkum v oblasti molekulární genetiky, tak na vývoj nástrojů, databází a serverů pro výpočetní molekulární genetiku a bioinformatiku a na spolupráci při poskytování bioinformatických služeb. Je členem infrastruktury Elixir.

Zaměření výzkumu

« Swipněte pro zobrazení dalších záložek »
Výpočetní biologie/bioinformatika

Původní výzkumné projekty výpočetní biologie/bioinformatiky

Systémová biologie transkripční regulace (modelování transkripčních regulačních sítí, predikce regulonů transkripčních faktorů).

Výpočetní biologie RNA (úloha struktur pre-snRNA v iniciaci biogeneze spliceosomu a mRNA UTR v translaci genů, výpočetní identifikace ncRNA genů).

Laboratoř je autorem následujících veřejných bioinformatických služeb založených na algoritmech vyvinutých laboratoří, které provozuje ELIXIR-CZ:

  • rPredictorDB – prediktivní databáze sekundárních struktur ncRNA
  • cpPredictor – server pro predikci struktury RNA
  • rboAnalyzer – server pro integrované vyhodnocení vyhledávání BLASTem pro nekódující RNA
  • Genexpi – nástroj pro inferenci genetických sítí z dat o časovém průběhu genové exprese
  • SWICZ – švýcarsko-český proteomický server
  • github.com/cas-bioinf

Naše publikace

Načíst další

Náš tým

Seznamte se s členy našeho týmu Laboratoře bioinformatiky