Bioinformatika
Laboratoř se zaměřuje jak na původní výzkum v oblasti molekulární genetiky, tak na vývoj nástrojů, databází a serverů pro výpočetní molekulární genetiku a bioinformatiku a na spolupráci při poskytování bioinformatických služeb. Je členem infrastruktury Elixir.
Zaměření výzkumu
« Swipněte pro zobrazení dalších záložek »
Původní výzkumné projekty výpočetní biologie/bioinformatiky
Systémová biologie transkripční regulace (modelování transkripčních regulačních sítí, predikce regulonů transkripčních faktorů).
Výpočetní biologie RNA (úloha struktur pre-snRNA v iniciaci biogeneze spliceosomu a mRNA UTR v translaci genů, výpočetní identifikace ncRNA genů).
Laboratoř je autorem následujících veřejných bioinformatických služeb založených na algoritmech vyvinutých laboratoří, které provozuje ELIXIR-CZ:
- rPredictorDB – prediktivní databáze sekundárních struktur ncRNA
- cpPredictor – server pro predikci struktury RNA
- rboAnalyzer – server pro integrované vyhodnocení vyhledávání BLASTem pro nekódující RNA
- Genexpi – nástroj pro inferenci genetických sítí z dat o časovém průběhu genové exprese
- SWICZ – švýcarsko-český proteomický server
- github.com/cas-bioinf
Náš tým
Seznamte se s členy našeho týmu Laboratoře bioinformatiky