Mycobiomes of two distinct clades of ambrosia gall midges (Diptera: Cecidomyiidae) are species-specific in larvae but similar in nutritive mycelia 2024 Laboratoř genetiky a metabolismu hubPyszko P.Šigutová H.Kolařík M.Kostovčík M.Ševčík J.Šigut M.Višňovská D.Drozd P.Microbiology Spectrum. 2024; 12(1); e028302310.1128/spectrum.02830-23
Concentration-dependent effect of plant secondary metabolites on bacterial and fungal microbiomes in caterpillar guts 2024 Laboratoř genetiky a metabolismu hubŠigutová H.Pyszko P.Šigut M.Czajova K.Kostovčík M.Kolařík M.Hařovská D.Drozd P.Microbiology Spectrum. 2024; 12(1); 029942310.1128/spectrum.02994-23
Seasonal Shifts in Bacterial and Fungal Microbiomes of Leaves and Associated Leaf-Mining Larvae Reveal Persistence of Core Taxa Regardless of Diet 2023 Laboratoř genetiky a metabolismu hubŠigutová H.Šigut M.Pyszko P.Kostovčík M.Kolařík M.Drozd P.Microbiology Spectrum. 2023; 11(1); 03160-2210.1128/spectrum.03160-22
Proportions of taxa belonging to the gut core microbiome change throughout the life cycle and season of the bark beetle Ips typographus 2023 Laboratoř genetiky a metabolismu hubVeselská T.Švec K.Kostovčík M.Peral-Aranega E.García Fraile P.Křížková B.Havlíček V.Saati Santamaria Z.Kolařík M.FEMS Microbiology Ecology. 2023; 99(8); fiad07210.1093/femsec/fiad072
New insight into the bark beetle ips typographus bacteriome reveals unexplored diversity potentially beneficial to the host 2023 Laboratoř genetiky a metabolismu hubPeral-Aranega E.Saati Santamaria Z.Ayuso-Calles M.Kostovčík M.Veselská T.Švec K.Rivas R.Kolařík M.García Fraile P.Environmental Microbiome. 2023; 18(1); 5310.1186/s40793-023-00510-z
Interindividual differences contribute to variation in microbiota composition more than hormonal status: A prospective study 2023 Laboratoř buněčné a molekulární imunologieJacková Z.Štěpán J.Coufal .Kostovčík M.Galanová N.Reiss Z.Pavelka K.Wenchich L.Hrušková H.Kverka M.Frontiers in Endocrinology. 2023; 14(March 8); 113905610.3389/fendo.2023.1139056
Specific gut bacterial and fungal microbiota pattern in the first half of pregnancy is linked to the development of gestational diabetes mellitus in the cohort including obese women 2022 Laboratoř genetiky a metabolismu hubVavrečková M.Galanová N.Kostovčík M.Krystynik O.Ivanovová E.Roubalová R.Jirásková Zákostelská Z.Friedecký D.Friedecká J.Haluzík M.Karásek D.Kostovčíková K.Frontiers in Endocrinology. 2022; 13(Sep 5); 97082510.3389/fendo.2022.970825
Fungi are more transient than bacteria in caterpillar gut microbiomes 2022 Laboratoř genetiky a metabolismu hubŠigut M.Pyszko P.Šigutová H.Višňovská D.Kostovčík M.Kotásková N.Dorňák O.Kolařík M.Drozd P.Scientific Reports. 2022; 12(1); 1555210.1038/s41598-022-19855-5
Diet Rich in Simple Sugars Promotes Pro-Inflammatory Response via Gut Microbiota Alteration and TLR4 Signaling 2020 Laboratoř buněčné a molekulární imunologieFajstová A.Galanová N.Coufal .Málková J.Kostovčík M.Čermáková M.Pelantová H.Kuzma M.Šedivá B.Hudcovic T.Hrnčíř T.Tlaskalová-Hogenová H.Kverka M.Kostovčíková K.Cells. 2020; 9(12); 270110.3390/cells9122701
Selection of the Root Endophyte Pseudomonas brassicacearum CDVBN10 as Plant Growth Promoter for Brassica napus L. Crops 2020 Laboratoř genetiky a metabolismu hubJimenez-Gomez A.Saati Santamaria Z.Kostovčík M.Rivas R.Velazquez E.Mateos P.Menéndez E.Garcia-Fraile P.Agronomy. 2020; 10(11); 178810.3390/agronomy10111788
Caterpillar gut and host plant phylloplane mycobiomes differ: a new perspective on fungal involvement in insect guts 2020 Laboratoř genetiky a metabolismu hubVišňovská D.Pyszková M.Šigut M.Kostovčík M.Kolařík M.Kotásková N.Drozd P.FEMS Microbiology Ecology. 2020; 96(9); fiaa11610.1093/femsec/fiaa116
Microbiome and Metabolome Profiles Associated With Different Types of Short Bowel Syndrome: Implications for Treatment 2020 Laboratoř genetiky a metabolismu hubBudínská E.Gojda J.Heczková M.Bratová M.Daňková H.Wohl P.Baštová H.Lánská V.Kostovčík M.Dastych M.Šenkyřík M.Křížová J.Mráz M.Hradecký J.Hajslová J.Leníček M.Podzimková K.Chalupský K.Sedláček R.Cahová M.Journal of Parenteral and Enteral Nutrition. 2020; 44(1); 105-11810.1002/jpen.1595
Dietary casein increases the sensitivity to colitis by stimulating colonic monocytes. 2019 Laboratoř buněčné a molekulární imunologieFaistová A.Kostovčíková K.Galanová N.Coufal .Kostovčík M.Hudcovic T.Procházková P.Jirásková Zákostelská Z.Šedivá B.Kuzma M.Čermáková M.Tlaskalová-Hogenová H.Kverka M.In: NEUVEDEN; N.; ed. Book of Proceedings. Praha: RADANAL; Ltd.; 2019; s. 82
High-diversity microbiomes in the guts of bryophagous beetles (Coleoptera: Byrrhidae) 2019 Laboratoř genetiky a metabolismu hubPyszko P.Šigut M.Kostovčík M.Drozd P.Hulcr J.European Journal of Entomology. 2019; 116(NOV 2019); 432-44110.14411/eje.2019.044
Adaptive traits of bark and ambrosia beetle-associated fungi 2019 Laboratoř genetiky a metabolismu hubVeselská T.Skelton J.Kostovčík M.Hulcr J.Baldrian P.Chudíčková M.Cajthaml T.Vojtová T.García Fraile P.Kolařík M.Fungal Ecology. 2019; 41(OCT 2019); 165-17610.1016/j.funeco.2019.06.005
Bark Beetle Population Dynamics in the Anthropocene: Challenges and Solutions 2019 Laboratoř genetiky a metabolismu hubBiedermann P.Mueller J.Grégoire J.Gruppe A.Hagge J.Hammerbacher A.Hofstetter R.Kandasamy D.Kolařík M.Kostovčík M.Krokene P.Salle A.Six D.Turrini T.Vanderpool D.Wingfield M.Baessler C.Trends in Ecology & Evolution. 2019; 34(10); 914-92410.1016/j.tree.2019.06.002
Lichens in old?growth and managed mountain spruce forests in the Czech Republic: assessment of biodiversity; functional traits and bioindicators 2019 Laboratoř genetiky a metabolismu hubMalíček J.Palice Z.Vondrák J.Kostovčík M.Lenzová V.Hofmeister J.Biodiversity and Conservation. 2019; 28(13); 3497-352810.1007/s10531-019-01834-4
Crucial Role of Microbiota in Experimental Psoriasis Revealed by a Gnotobiotic Mouse Model 2019 Laboratoř buněčné a molekulární imunologieStehlíková Z.Kostovčíková K.Kverka M.Rossmann P.Dvořák J.Novosádová I.Kostovčík M.Coufal .Šrůtková D.Procházková P.Hudcovic T.Kozáková H.Štěpánková R.Rob F.Jůzlová K.Herzogová J.Tlaskalová-Hogenová H.Zákostelská Z.Frontiers in Microbiology. 2019; 10(FEB 21); 23610.3389/fmicb.2019.00236
Dysbiosis of Skin Microbiota in Psoriatic Patients: Co-occurrence of Fungal and Bacterial Communities 2019 Laboratoř genetiky a metabolismu hubStehlíková Z.Kostovčík M.Kostovčíková K.Kverka M.Jůzlová K.Rob F.Herzogová J.Boháč P.Pinto Y.Uzan A.Koren O.Tlaskalová-Hogenová H.Jirásková Zákostelská Z.Frontiers in Microbiology. 2019; 10(MARCH 21); 43810.3389/fmicb.2019.00438
Diet Rich in Animal Protein Promotes Pro-inflammatory Macrophage Response and Exacerbates Colitis in Mice 2019 Laboratoř buněčné a molekulární imunologieKostovčíková K.Coufal .Galanová N.Fajstová A.Hudcovic T.Kostovčík M.Procházková P.Zákostelská Z.Čermáková M.Šedivá B.Kuzma M.Tlaskalová-Hogenová H.Kverka M.Frontiers in Immunology. 2019; 10(APR 26); 91910.3389/fimmu.2019.00919
