14. 11. 2024
Biologie a metabolismus hub
Kolařík Lab
Zaměřujeme se na poznání biologie různých skupin hub s velkým významem pro člověka. Používáme interdisciplinární přístup, který zahrnuje studium evoluce, diverzity, ekologie, epidemiologie, taxonomie, fyziologie, biogeografie, patogenity a sekundárních metabolitů. Mezi zkoumané skupiny patří fytopatogenní námelové houby (rod Claviceps), symbiotické houby spojené s hmyzem (kůrovci, motýli, pilořitky atd.), patogeny netopýrů, málo prozkoumané linie hub, bazidiomycety z Červeného seznamu, toxigenní houby jako Aspergillus, Penicillium a dermatofyty. Tým se zabývá klinickými houbami a jejich mechanismy speciace, epidemiologií, diagnostikou a rezistencí k léčivům. Studujeme sekundární metabolity s cílem porozumět jejich ekologické roli a hledat biotechnologické aplikace. Používané metody zahrnují taxonomické analýzy, fylogenetiku, transkriptomiku, populační genetiku, analýzu mikrobiálních společenstev a testování biologické aktivity. Tým se také účastní osvětových a projektů občanské vědy.
Zaměření výzkumu
Mikrobiální symbiózy herbivorního hmyzu
V našem týmu studujeme symbionty housenek motýlů (Lepidoptera), ambrosiových bejlomorek (Diptera, Cecidomyiidae), pilořitek (Hymenoptera, Siricidae), kůrovců (Curculionidae, Scolytinae), jádrohlodů (Curculionidae, Platypodinae) a termitů (Isoptera, Termitoidae).
číst více
Námel, rod Claviceps
Naše laboratoř má největší sbírku námelovitých hub na světě (Culture Collection of Clavicipitaceae, CCC) a věnuje se výzkumu evoluce, diverzity, toxicity, taxonomie a ekologie těchto hub.
číst více
Sekundární metabolity
Houby jsou významní producenti přírodních chemických látek, sekundárních metabolitů, které nacházejí uplatnění v zemědělství, lékařství a potravinářství. V rámci našich projektů identifikujeme přírodní látky málo studovaných hub.
číst více
Druhové hranice a diverzita rodu Aspergillus
Aspergillus (Ascomycota: Eurotiales) je rod vláknitých hub zahrnující klinicky, biotechnologicky a toxikologicky významné houby. Náš tým se věnuje studiu diverzity a taxonomie těchto hub a popsal desítky nových druhů, včetně klinicky a potravinářsky významných zástupců.
číst více
Houbové patogeny člověka a zvířat
Věnujeme se komplexnímu poznání hub působících onemocnění člověka a zvířat. Zaměřujeme se na tzv. „emerging diseases“, nemoci, které se nově objevují nebo rychle šíří v populaci.
číst více
Diverzita a taxonomie přehlížených skupin hub
Z odhadovaného celkového počtu druhů hub, 1,5 až 6,3 milionu, je dosud popsáno kolem 150 tisíc. Velká část diverzity hub je tedy dosud nepopsána. V našich studiích se zaměřujeme na ty skupiny neprobádaných hub, které mají nějaký význam pro člověka.
číst více
Mikrobiální lipidy
Lipidy jsou nezbytnou součástí všech buněk a slouží jako základní stavební komponenty buněčných membrán a jako zdroje energie. V naší práci se zaměřujeme na detailní charakterizaci složení lipidů bakterií, hub a řas.
číst více
Sbírka kultur námelovitých hub
Culture Collection of Clavicipitaceae (CCC) je se svými cca 1400 kmeny největší sbírkou hub rodu Claviceps na světě. Obsahuje řadu typových kmenů.
číst víceSlužby pro veřejnost
- Identifikace hub pomocí fenotypu a genotypu
- Identifikace přírodních látek produkovaných mikroorganismy
- Fyziologická charakterizace mikrobiálních kmenů
- Poskytování kmenů ze sbírky CCC – Collection of Clavicipitaceae
Naše publikace
Náš tým
Seznamte se s členy našeho týmu Laboratoře genetiky a metabolismu hub
Kolařík Lab