Evoluce, ekologie, diverzita a toxicity námele, rodu Claviceps
Rod Claviceps (Ascomycota, Hypocreales), známý jako paličkovice, či námel, zahrnuje přes 60 druhů parazitujících na květenství travin, včetně pěstovaných obilovin. Tyto houby mají značný význam v zemědělství, potravinářství a farmacii. Jsou významní svojí produkcí toxických námelových alkaloidů, které jsou příčinou otrav, ale také zdrojem léčiv. Bývalý člen týmu, Dr. Sylvia Pažoutová zasvětila svůj profesní život práci na námelu. Náhle zemřela v září 2013 a my v její práci pokračujeme. Naše laboratoř má největší sbírku námelovitých hub na světě (Culture Collection of Clavicipitaceae, CCC) a věnuje se výzkumu evoluce, diverzity, toxicity, taxonomie a ekologie těchto hub.
Paličkovice nachová (Claviceps purpurea)
Mimo jiné jsme objevili, že patogen žita, druh paličkovice nachová (Claviceps purpurea) je komplex několika příbuzných druhů, které se liší svým hostitelským spektrem. To má zásadní význam při ochraně polní produkce před tímto toxickým patogenem obilovin. Jako první jsme rekonstruovali evoluční historii celého rodu a ukázali, že se skládá z několika velmi odlišných skupin (popsaných jako sekce), které mají odlišné hostitelské spektrum, geografické rozšíření a toxicitu. Náš tým popsal desítky nových druhů námelu z celého světa. Poprvé jsme poukázali na opomíjenou roli ergochromů v toxicitě námele.
Hlavní výsledky jsou shrnuty v následujících pracích, z nichž je také patrná šíře naší mezinárodní spolupráce, která zahrnuje týmy z Kanady, Japonska, USA, Jižní Afriky a dalších zemí.
- Pazoutova S, Pesicova K, Chudickova M, Srutka P, Kolařík M (2015) Delimitation of cryptic species inside Claviceps purpurea. Fungal Biology 119: 7-26.
- van der Linde EJ, Pešicová K, Pažoutová S, Stodůlková E, Flieger M, Kolařík M (2016) Ergot species of the Claviceps purpurea group from South Africa. Fungal Biology 120: 917-30.
- Píchová K, Pažoutová S, Kostovčík M, Chudíčková M, Stodůlková E, Novák P, Flieger M, van der Linde E, Kolařík M (2018) Evolutionary history of ergot with a new infrageneric classification (Hypocreales: Clavicipitaceae: Claviceps). Molecular Phylogenetics and Evolution 123: 3-87.
- Flieger M, Stodůlková E, Wyka SA, Černý J, Grobárová V, Píchová K, Novák P, Man P, Kuzma M, Cvak L, Broders KM, Kolařík M (2019) Ergochromes: heretofore neglected dide of rrgot toxicity. Toxins 11: 439
- Liu M, Findlay W, Dettman J, Wyka SA, Broders K, Shoukouhi P, Dadej K, Kolařík M, Basnyat A, Menzies JG (2021) Mining indole alkaloid synthesis gene clusters from genomes of 53 Claviceps strains revealed redundant gene copies and an approximate evolutionary hourglass model. Toxins 13: 799.
- Liu M, Tanaka E, Kolařík M (2022) Neotypification of Claviceps humidiphila and recognition of C. bavariensis sp. nov. Mycotaxon 137: 73-87.
- Liu M, Kolařík M, Tanaka E (2022) The 168-year taxonomy of Claviceps in the light of variations: From three morphological species to four sections based on multigene phylogenies. Canadian Journal of Plant Pathology, 44: 783–792
- van der Linde EJ, Píchová K, Pažoutová S, Stodůlková E, Flieger M, Novák P, Kolařík M (2022) Pre-invasion assessment on African invasive grasses revealed five new species of ergot fungi, Claviceps section Pusillae. Fungal Biology 126: 752-763
- Tanaka E, Tanada K, Hosoe T, Shrestha B, Kolařík M, Liu M (2023) In search of lost ergots: phylogenetic re-evaluation of Claviceps species in Japan and their biogeographic patterns revealed. Studies in Mycology 106: 1–39