cz
en

Vyhledávání

Diverzita a taxonomie přehlížených skupin hub

Laboratoř genetiky a metabolismu hub
Menu

Diverzita a taxonomie přehlížených skupin hub

Z odhadovaného celkového počtu druhů hub, 1,5 až 6,3 milionu, je dosud popsáno kolem 150 tisíc. Velká část diverzity hub je tedy dosud nepopsána. V našich studiích se zaměřujeme na ty skupiny neprobádaných hub, které mají nějaký význam pro člověka. Jsou to jednak houby s potenciálem produkce nových chemických látek a houby důležité pro ochranu životního prostředí. Provádíme vysoce kvalitní taxonomické studie za použití genomických dat a nástrojů studia geografie z envDNA. Pokročilé metody zpřístupňujeme širší mykologické veřejnosti. Naše práce vedla k popisu jedné nové čeledi a řady nových rodů a druhů hub.

Hlavní výsledky jsou shrnuty v následujících pracích, z nichž je také patrná šíře naší mezinárodní spolupráce, která zahrnuje týmy z celého světa.

  • Kubátová A, Hujslová M, Frisvad JC, Chudíčková M, Kolařík M (2019) Taxonomic revision of the biotechnologically important species Penicillium oxalicum with the description of two new species from acidic and saline soils. Mycological Progress 18: 215-228.
  • Holec J, Kunca V, Kolařík M (2019) Tricholomopsis badinensis sp. nov. and T. sulphureoides—two rare fungi of European old-growth forests. Mycological Progress 18: 321-334.
  • Janda V, Kříž M, Kolařík M (2019) Butyriboletus regius and Butyriboletus fechtneri: typification of two well-known species. Czech Mycol 71: 1-32.
  • Kříž M, Jindřich O, Kolařík M (2019) Contribution to the knowledge of mycobiota of Central European dry grasslands: Phaeoclavulina clavarioides and Phaeoclavulina roellinii (Gomphales). Czech Mycology 7: 137-150.
  • Antonín V, Borovička J, Holec J, Piltaver A, Kolařík M (2019) Taxonomic update of Clitocybula sensu lato with a new generic classification. Fungal Biology 123: 431-447.
  • Caboň M, Li G-J, Saba M, Kolařík M, Jančovičová S, Khalid AN, Moreau P-A, Wen H-A, Pfister DH, Adamčík S (2019) Phylogenetic study documents different speciation mechanisms within the Russula globispora lineage in boreal and arctic environments of the Northern Hemisphere. IMA Fungus 10: 5.
  • Stadler M, Lambert C, Wibberg D, Kalinowski J, Cox RJ, Kolařík M, Kuhnert E (2020) Intragenomic polymorphisms in the ITS region of high-quality genomes of the Hypoxylaceae (Xylariales, Ascomycota). Mycological Progress 19: 235-245.
  • Větrovský T, et al. (2020) GlobalFungi, a global database of fungal occurrences from high-throughput-sequencing metabarcoding studies. Scientific Data 7: 228.
  • Réblová M, Nekvindová J, Kolařík M, Hernández-Restrepo M (2021) Delimitation and phylogeny of Dictyochaeta, and introduction of Achrochaeta and Tubulicolla, genera nova. Mycologia 113: 390-433.
  • Réblová M, Kolařík M, Nekvindová J, Miller AN, Hernández-Restrepo M (2021) Phylogeny, global biogeography and pleomorphism of Zanclospora. Microorganisms 9: 706.
  • Kolařík M, Stępniewska H, Jankowiak R (2021) Taxonomic revision of the acidophilic genus Acidiella (Dothideomycetes, Capnodiales) with a description of new species from Poland. Plant Systematics and Evolution 307: 1-13.
  • Holec J, Vampola P, Kout J, Beran M, Krisai-Greilhuber I, Hahn C, Kolařík M (2021) Polyporus tubaeformis (Basidiomycota, Polyporaceae)-identity, ecology and distribution in the Czech Republic, Austria, Slovakia and Ukraine. Sydowia 73: 245-256
  • Réblová M, Kolařík M, Nekvindová J, Réblová J, Sklenář F, Miller AN, Hernández-Restrepo M (2021) Phylogenetic reassessment, taxonomy, and biogeography of Codinaea and similar fungi. Journal of Fungi 7: 1097.
  • Kolařík M, Wei I, Hsieh S-Y, Piepenbring M, Kirschner R (2021) Nucleotide composition bias of rDNA sequences as a source of phylogenetic artifacts in Basidiomycota—a case of a new lineage of a uredinicolous Ramularia-like anamorph with affinities to Ustilaginomycotina. Mycological Progress 20: 1553-1571. 
  • Holec J, Borovička J, Peintner U, Kolařík M (2022) Towards consolidation of Gymnopilus taxonomy: the case of G. stabilis, G. sapineus, and G. penetrans. Mycological Progress 21:327-343.
  • Antonín V, Hosaka K, Kolařík M. (2023) Taxonomy and phylogeny of Paramarasmius gen. nov. and Paramarasmius mesosporus, a worldwide distributed fungus with a strict ecological niche. Plant Biosystems-An International Journal Dealing with all Aspects of Plant Biology: 157:2, 286-293
  • Karasiński D, Nagy LG, Szarkándi JG, Dvořák D, Kolařík M, Holec J. (2023) Cyphelloporia bialoviesensis (Fungi, Agaricales)—a new genus and species for a giant cyphelloid fungus from Białowieża virgin forest in Poland. Phytotaxa 589:119-136.
  • Kolařík M, Vrublevskaya M, Kajzrová S, Kulišová M, Kolouchová IJ. (2023) Taxonomic analysis reveals host preference of rare fungi in endophytes of Vitis vinifera from the Czech Republic. Folia microbiologica:1-15.
  • Cedeño-Sanchez M, Cheng T, Lambert C, Kolarík M, Kuhnert E, Cox RJ, et al. Unraveling intragenomic polymorphisms in the high-quality genome of Hypoxylaceae: a comprehensive study of the rDNA cistron. Mycological Progress. 2024;23:5.
  • Valda S, Kolařík M (2024) Surprising discovery of Sedecula pulvinata in Central Europe–is it really a species endemic to the western USA? Czech Mycology, 76: 33-44