Houbové patogeny člověka a zvířat
Věnujeme se komplexnímu poznání hub působících onemocnění člověka a zvířat. Zaměřujeme se na tzv. „emerging diseases“, nemoci, které se nově objevují nebo rychle šíří v populaci. Současná doba je právě ve znamení těchto nových nemocí. Studujeme dermatofyty, rod Aspergillus, Candida, Pseudogymnoscus destructans (původce White Nose Syndrome netopýrů) a další skupiny. Dermatofyty (též dermatofyta, řád Onygenales) jsou skupinou plísní, které způsobují řadu kožních onemocnění včetně postižení vlasů a nehtů. Prvním krokem při hledání nových nemocí je zjištění spektra stávajících druhů, tedy studium epidemiologie. Epidemiologická studie probíhá ve spolupráci s řadou klinických a veterinárních pracovišť v ČR i jinde ve světě. Díky ní jsme zachytili nárůst výskytu několika druhů dermatofyt. Příkladem je Trichophyton benhamiae přenášený morčaty, T. erinacei přenášený ježky či T. quinckeanum přenášený psy a kočkami. Populačně genetický rozbor těchto druhů a komplexu druhu T. mentagrophytes nám umožnil rozlišovat kryptické druhy a stopovat jejich migrační cesty. Naše studium vedlo k popisu mnoha nových druhů, jako je Auxarthron ostraviense, Trichophyton europeum, T. japonicum, T. onychocola a T. spiraliforme. Dále vylepšujeme diagnostické postupy a komunikujeme s lékařskou veřejností. Studujeme volně žijící savce, zejména hlodavce a ježky a ptáme se, jestli jsou rezervoár dosud neznámých dermatofyt, potenciálních nových patogenů člověka. Studujeme sekundární metabolity dermatofyt, včetně těkavých látek, a zjišťujeme, jestli hrají roli ve virulenci či zda je lze použít při diagnostice. U nových patogenů hledáme, jaké faktory virulence stojí za jejich úspěšným šířením. Dále sledujeme výskyt lékové rezistence u dermatofyt, Aspergillus fumigatus a Candida spp.
Hlavní výsledky jsou shrnuty v následujících pracích, z nichž je také patrná šíře naší mezinárodní spolupráce, která zahrnuje týmy z celého světa.
- Hubka V, Čmoková A, Peano A, Větrovský T, Dobiáš R, Mallátová N, Lysková P, Mencl K, Janouškovcová H, Stará J, Kuklová I, Doležalová J, Hamal P, Svobodová L, Koubková J, Kolařík M (2018) Zoonotické dermatofytózy: klinický obraz, diagnostika, etiologie, léčba, epidemiologická situace u nás. Československá Dermatologie 93: 205–292.
- Lysková P, Dobiáš R, Kuklová I, Mallátová N, Čmoková A, Kolařík M, Vojtíšková V, Karpetová L, Hubka V (2018) Pět případů lidských dermatofytóz vyvolaných zoofilním druhem Trichophyton erinacei přeneseným z ježků. Československá Dermatologie 93: 237-243.
- Lysková P, Skruzná M, Kubánek M, Kautznerová D, Hosková L, Vrbská J, Zácková P, Dobias R, Jaworská P, Mrázek J, Kolarík M, Sumerauerová P, Nemcová D, Hubka V (2019) Cryptic Aspergillus species – A case report of chronic cavitary pulmonary Aspergillus lentulus infection in a heart transplant recipient. Klinicka Mikrobiologie a Infekcni Lekarstvi 25: 48-52
- Veselská T, Homutová K, Fraile PG, Kubátová A, Martínková N, Pikula J, Kolařík M (2020) Comparative eco-physiology revealed extensive enzymatic curtailment, lipases production and strong conidial resilience of the bat pathogenic fungus Pseudogymnoascus destructans. Scientific reports 10: 1-13.
- Řeulka J, Kolařík M, Hubka V (2020) Clinical and histopathological changes in rainbow trout Oncorhynchus mykiss experimentally infected with fungus Bradymyces oncorhynchi. Folia Microbiologica 65, 1025–1032
- Čmoková A, Kolařík M, Dobiáš R, Hoyer LL, Janouškovcová H, Kano R, Kuklová I, Lysková P, Machová L, Maier T, Mallátová N, Man M, Mencl K, Nenoff P, Peano A, Prausová H, Stubbe D, Uhrlaß S, Větrovský T, Wiegand C, Hubka V (2020) Resolving the taxonomy of emerging zoonotic pathogens in the Trichophyton benhamiae complex. Fungal Diversity 104: 333-387
- Čmoková A, Rezaei-Matehkolaei A, Kuklová I, Kolařík M, Shamsizadeh F, Ansari S, Gharaghani M, Miňovská V, Najafzadeh MJ, Nouripour‐Sisakht S (2021) Discovery of new Trichophyton members, T. persicum and T. spiraliforme spp. nov., as a cause of highly inflammatory tinea cases in Iran and Czechia. Microbiology Spectrum 9:e00284-00221
- Lysková P, Dobiáš R, Čmoková A, Kolařík M, Hamal P, Šmatláková K, Hušek J, Mencl K, Mallátová N, Poláčková Z (2021) An outbreak of Trichophyton quinckeanum zoonotic infections in the Czech Republic transmitted from cats and dogs. Journal of Fungi 7: 684.
- Čmoková A, Kolařík M, Guillot J, Risco-Castillo V, Cabañes F, Nenoff P, Uhrlaß S, Dobiáš R, Mallátová N, Yaguchi T. V. Hubka (2022) Host-driven subspeciation in the hedgehog fungus, Trichophyton erinacei, an emerging cause of human dermatophytosis. Persoonia-Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi 48:203-218.
- Moulíková Š, Kolařík M, Lorch JM, Kolarczyková D, Hubka V, Čmoková A. (2023) Wild rodents harbour high diversity of Arthroderma. Persoonia-Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi 50:27-47.
- Seidlova V, Pikula J, Kolarik M, Nováková A, Cmokova A, Ghazaryan A, Nemcova M, Bednarikova S, Patra S, Kokurewicz T. (2023) Higher white-nose syndrome fungal isolate yields from UV-guided wing biopsies compared with skin swabs and optimal culture media. BMC Veterinary Research 19:1-12.
- Řehulka J, Kubátová A, Hubka V. (2023) A visceral mycosis in farmed rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) caused by Neopyrenochaeta submersa. Medical Mycology Case Reports 41: 4-7
- de Hoog S, et al. (2023) A conceptual framework for nomenclatural stability and validity of medically important fungi: a proposed global consensus guideline for fungal name changes supported by ABP, ASM, CLSI, ECMM, ESCMID-EFISG, EUCAST-AFST, FDLC, IDSA, ISHAM, MMSA, and MSGERC. J Clin Microbiol 61:e00873-23.
- Švarcová M, Větrovský T, Kolařík M, Hubka V. (2023) Defining the relationship between phylogeny, clinical manifestation, and phenotype for Trichophyton mentagrophytes/interdigitale complex; a literature review and taxonomic recommendations. Medical Mycology 61:myad042.
- Kolarczyková D, Lysková P, Švarcová M, Kuklová I, Dobiáš R, Mallátová N, Kolařík M, Hubka V (2024) Terbinafine resistance in Trichophyton mentagrophytes and Trichophyton rubrum in the Czech Republic: A prospective multicentric study. Mycoses 67(2):e13708.
- Řehulka J, Hubka V (2024) A renal mycosis of roach (Rutilus rutilus) caused by the Aureobasidium pullulans. Medical Mycology Case Reports 44: 100652