Cíle projektu:
Hlavnı́m cı́lem ODEEP-EU je zefektivnit opětovné použitı́ veřejných dat z oblasti proteomiky. Důležité je, že toto opětovné použitı́ veřejně dostupných dat, které musı́ být podpořeno volně dostupnými zdrojovými kódy a softwarem, je spojeno s třemi klı́čovými aspekty: (i) vytvořenı́ a udrženı́ referenčnı́ch datasetů včetně jejich anotace a návodů na opětovné použitı́; (ii) snı́ženı́ složitosti postupů pro opětovné použitı́ pomocı́ anotace metadat, dostupnosti vysoce kvalitnı́ch dat pro danou problematiku a existence volně dostupných softwarových řešenı́ pro opětovnou analýzu; a (iii) integrace již existujı́cı́ch frameworků (z projektu ELIXIR) pro sdı́lenı́ volně dostupných softwarů a zálohovánı́ do systému Software Heritage. V rámci projektů propojı́me vědeckou komunitou (zejména v oblastech struktury bı́lkovin, biochemie, molekulárnı́ a terénnı́ biologie) v akademické sféře a průmyslu. Výsledkem bude existence stabilnı́ho a důvěryhodného prostředı́ pro uchovávaní proteomických dat včetně opětovnému použití.
Na daný projekt je poskytována finanční podpora od Evropské unie.
Poskytovatel | TAČR |
Operační program | Epsilon |
Číslo projektu | TH86010001 |
Trvání projektu | 01/2024 – 12/2025 |
Příjemce | Mikrobiologický ústav, AV ČR, v. v. i. |
Partneři | Ghent University, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien – IPHC, European Bioinformatics Institute |