Ekosystém pro sdílení volně dostupných proteomických dat: Rozšíření jeho funkcí

Hlavnı́m cı́lem ODEEP-EU je zefektivnit opětovné použitı́ veřejných dat z oblasti proteomiky. Důležité je, že toto opětovné použitı́ veřejně dostupných dat, které musı́ být podpořeno volně dostupnými zdrojovými kódy a softwarem, je spojeno s třemi klı́čovými aspekty: (i) vytvořenı́ a udrženı́ referenčnı́ch datasetů včetně jejich anotace a návodů na opětovné použitı́; (ii) snı́ženı́ složitosti postupů pro opětovné použitı́ pomocı́ anotace metadat, dostupnosti vysoce kvalitnı́ch dat pro danou problematiku a existence volně dostupných softwarových řešenı́ pro opětovnou analýzu; a (iii) integrace již existujı́cı́ch frameworků (z projektu ELIXIR) pro sdı́lenı́ volně dostupných softwarů a zálohovánı́ do systému Software Heritage. V rámci projektů propojı́me vědeckou komunitou (zejména v oblastech struktury bı́lkovin, biochemie, molekulárnı́ a terénnı́ biologie) v akademické sféře a průmyslu. Výsledkem bude existence stabilnı́ho a důvěryhodného prostředı́ pro uchovávaní proteomických dat včetně opětovnému použití.

Na daný projekt je poskytována finanční podpora od Evropské unie.