P. Branny – prokaryotická skupina
Výzkum v prokaryotické skupině pod vedením Pavla Branného se zaměřuje na molekulární mechanismy, které bakterie využívají k vnitrobuněčné a mezibuněčné komunikaci. Naším cílem je pochopit, jak bakterie detekují četné signály z prostředí a jak integrace a zpracování těchto informací vede k přesné regulaci buněčných dějů. Jedním ze základních mechanizmů, kterými bakterie zpracovávají informace, je reverzibilní fosforylace a defosforylace proteinů pomocí proteinkináz a proteinfosfatáz. V naší práci se zaměřujeme na charakterizaci funkčně málo prozkoumaných Ser/Thr proteinkináz tzv. eukaryotického typu.
Hlavním cílem naší práce je získat přehled o aktivaci, lokalizaci a dynamice StkP in vivo a prozkoumat význam fosforylace jejích substrátů. Za tímto účelem jsme identifikovali celou řadu proteinů, které jsou fosforylované StkP a v současné době studujeme jejich roli v regulaci buněčného dělení a v syntéze buněčné stěny.
Ve společném projektu s eukaryotickou skupinou analyzujeme, zda StkP hraje roli v interakci mezi patogenem a hostitelem. Vyvíjíme model pro studium interakce S. pneumoniae s epiteliálními buňkami a kolonizace buněk hostitelského organismu.