Fotosyntéza
komenda lab
Věnujeme se studiu fotosyntetických procesů u sinic a dalších mikrořas. Důležitou charakteristikou je multidisciplinární přístup, kombinujeme biofyziku, molekulární biologii, evoluční biologii, biochemii, fyziologii a klasickou mikrobiologii.
Centrum ALGATECH
Máme pět výzkumných skupin

- Řízení dráhy biosyntézy chlorofylu a mechanismy její koordinace s biosyntézou proteinů během biogeneze pigment-proteinových komplexů.
- Sestavení fotosystému z jednotlivých složek a lokalizace jednotlivých kroků.
- Kontrola kvality fotosyntetických membránových proteinů a jejich komplexů, role proteáz FtsH v buněčných procesech.
- Molekulární mechanismy řídící mikrobiální fotosyntézu u nově objevených a ekologicky důležitých fotosyntetických mikroorganismů za proměnlivých světelných i nutričních podmínek.
- Mechanismy regulace fotosyntézy a fixace dusíku u diazotrofních sinic, vliv zvýšené koncentrace CO2 na fixaci dusíku.
- Regulace a molekulární mechanismus fotoprotekce pigmentových proteinů řas a sinic.
- Stanovení mobility a dynamiky fotosyntetických membránových komplexů a role membránových mikrodomén ve fotosyntéze.
- Jak získaly různé skupiny řas schopnost fotosyntézy, jak jsou si vzájemně příbuzné a jak jejich činnost ovlivňuje prostředí kolem nás.

Aplikovaný výzkum
- Nový design a vylepšení nástrojů pro výzkum fotosyntézy včetně kultivačních zařízení, mikroskopických technik a spektroskopických zařízení.
- Identifikace kmenů mikrořas a sinic vhodných pro produkci biomasy a cenných látek.
Výzkumné skupiny a zaměření
Skupina Josefa Komendy
Většinou s využitím modelové sinice Synechocystis PCC 6803 se zabývá mechanismy a regulací sestavování membránových pigment-proteinových komplexů a jejich kontrolou kvality. Zaměřuje se na roli strukturálních podjednotek a pomocných proteinových faktorů v procesu sestavování fotosystému II a na objasnění struktury a funkce homologů bakteriálních proteáz FtsH při degradaci strukturálních i regulačních proteinů účastnících se biogeneze fotosyntetického aparátu.
Číst víceSkupina Ondřeje Prášila
Zaměřujeme se na výzkum fotosyntetických procesů u sinic a dalších mikrořas, od úrovně molekulárních mechanismů po biogeochemické implikace.
Na subcelulární úrovni využíváme zejména metody fluorescenční mikroskopie pro studium mobility fotosyntetických proteinů a jejich organizace v tylakoidní mebráně.
Dále se zabýváme fyziologií fototrofů na úrovni jednotlivých buněk, jako je úloha heterogenity mezi buňkami u sinic fixujících dusík.
Dalším klíčovým zájmem naší skupiny je to, jak environmentální faktory jako je světlo a dostupnost živin regulují fotosyntetické procesy a fotoprotektivní mechanismy na úrovni populací.
Číst více