Post-transkripční kontrola genové exprese
Večeřek LAB
| Úvod Naše laboratoř se zaměřuje na molekulární aspekty patogeneze lidského patogenu Bordetella pertussis. B. pertussis je navracejí se respirační patogen a původce černého kašle (pertuse). Navzdory vakcinačním programům se výskyt tohoto onemocnění v rozvinutých zemích postupně zvyšuje. Věříme, že návrat černého kašle ukazuje, že potřebujeme rozšířit naše znalosti molekulárních mechanizmů, které kontrolují fyziologii a virulenci B. pertussis a ovlivňují patogenezi onemocnění. Proto využíváme genomiku, transkriptomiku, proteomiku a řadu bioinformatických nástrojů k objasnění evoluce a adaptace globální populace B. pertussis, k rozluštění molekulárních mechanizmů, které se účastní kontroly virulence a fitness, k analýze vztahu mezi patogenem a hostitelskou buňkou, a k identifikaci nových biomarkerů zodpovědných za patogenezi černého kašle. |
Co se u nás děje?
Zadaným kriteriím neodpovídá žádná aktualita.
Zaměření výzkumu
Analýza původních vakcinačních kmenů pertussis
Komparativní omická analýza původních vakcinačních kmenů pertussis z 50. let 20. století a českých kmenů izolovaných v letech 2008-2015. Cílem je zjistit jak více než 60 let celoplošného očkování změnilo fenotypové vlastnosti českých kmenů.
Číst více
Role RNA ve virulenci
Role RNA chaperonu Hfq a malých regulačních RNA ve virulenci a fitness pertussis.
Číst více
Mechanizmy regulující expresi
Mechanizmy regulující expresi a produkci sekrečního systému typu 3 a role tohoto faktoru virulence v patogenezi pertussis
Číst více
Interakce pertussis s lidskými makrofágy
Interakce pertussis s lidskými makrofágy se zřetelem na metabolické aspekty adaptace na intracelulární prostředí a strategie přežívání intracelulárních baktérií během infekce.
Číst víceMezinárodní spolupráce
- Dr. David Hot, Transcriptomics and Applied Genomics, Institute Pasteur de Lille, Lille, France
- (transkriptomické analýzy, malé regulační RNA)
- Prof. Dr. Ivo Hofacker, Dr. Fabian Amman, Institute of Theoretical Chemistry, Vienna, Austria
- (bioinformatické analýzy, transkriptomika)
- Dr. Maria Eugenia Rodriguez, School of Science, La Plata University, La Plata, Argentina
- (interakce B. pertussis s lidskými fagocyty)
- Domácí spolupráce:
- Prof. Peter Šebo, Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha
- (vztah hostitel-patogen, in vivo infekční experimenty)
- Dr. Hana Macíčková Cahová, Ústav organické chemie a biochemie, AVČR, Praha (modifikace a metabolismus RNA)
Náš tým
Seznamte se s členy našeho týmu Laboratoře post-transkripční kontroly genové exprese
Večeřek Lab