RIP-seq reveals RNAs that interact with RNA polymerase and primary sigma factors in bacteria Nucleic Acids Research. 2024; 52(May 8); 4604-46262024 Vaňková Hausnerová V.Shoman M.Kumar D.Schwarz M.Modrák M.Jirát Matějčková J.Mikesková E.Neva S.Herrmannová A.Šiková M.Halada P.Novotná I.Pajer J.Valášek L.Převorovský M.Krásný L.Hnilicová J.Zobrazit další (12) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1093/nar/gkae081
A new role of sigma factors in regulation of bacterial transcription Czech Chem. Soc. Symp. Series. 2023; 21(5); 210-2102023 Pospíšil J.Schwarz M.Ziková A.Vítovská D.Hradilová M.Kolář M.Křenková A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J.Zobrazit další (5) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
?E of Streptomyces coelicolor can function both as a direct activator or repressor of transcription Communications Biology. 2024; 7(January 6); 462024 Pospíšil J.Schwarz M.Ziková A.Vítovská D.Hradilová M.Kolář M.Křenková A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J.Zobrazit další (5) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese /10.1038/s42003-023-05716-y
Ms1 RNA Interacts With the RNA Polymerase Core in Streptomyces coelicolor and Was Identified in Majority of Actinobacteria Using a Linguistic Gene Synteny Search Frontiers in Microbiology. 2022; 13(MAY 11 2022); 8485362022 Vaňková Hausnerová V.Marvalová O.Šiková M.Shoman M.Havelková J.Kambová M.Janoušková M.Kumar D.Halada P.Schwarz M.Krásný L.Hnilicová J.Pánek J.Zobrazit další (8) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.3389/fmicb.2022.848536
rboAnalyzer webserver: web service for non-coding RNA characterization from NCBI BLAST output Bioinformatics. 2021; 37(17); 2755-27562021 Schwarz M.Vohradský J.Pánek J. Laboratoř bioinformatiky 10.1093/bioinformatics/btab073
NAD-capping: a universal RNA modification in Mycobacteria; Archaea and Escherichia coli FEBS Open Bio. 2021; 11(Suppl 1); 182021 Ruiz-Larrabeiti O.Benoni R.Zemlianski V.Hanišáková N.Suder A.Schwarz M.Brezovská B.Svojanovská B.Vítězová M.Cahová H.Převorovský M.Krásný L.Zobrazit další (7) Laboratoř bioinformatiky
Kinetic Modeling and Meta-Analysis of the Bacillus subtilis SigB Regulon during Spore Germination and Outgrowth Microorganisms. 2021; 9(1)2021 Vohradský J.Schwarz M.Ramaniuk O.Ruiz-Larrabeiti O.Vaňková Hausnerová V.Šanderová H.Krásný L.Zobrazit další (2) Laboratoř bioinformatiky 10.3390/microorganisms9010112
rboAnalyzer: A Software to Improve Characterization of Non-coding RNAs From Sequence Database Search Output Frontiers in genetics. 2020; 11(Jul 28); 6752020 Schwarz M.Vohradský J.Modrák M.Pánek J. Laboratoř bioinformatiky 10.3389/fgene.2020.00675
DNA mapping and kinetic modeling of the HrdB regulon in Streptomyces coelicolor. Nucleic Acids Research. 2019; 47(2); 621-6332019 Šmídová K.Ziková A.Pospíšil J.Schwarz M.Bobek J.Vohradský J.Zobrazit další (1) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1093/nar/gky1018
