Laboratoř environmentální mikrobiologie - Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Environmentální mikrobiologie

Baldrian lab

Výzkum zahrnuje ekologii, fyziologii a biochemii mikroorganismů (zejména hub a bakterií) v životním prostředí. Studovány jsou faktory ovlivňující mikrobiomy životního prostředí, fyziologie mikroorganismů v jejich přirozených stanovištích i v laboratorních kulturách a jejich podíl na ekosystémových procesech od jednotlivých vzorků až po globální úroveň. Na globální úrovni je mikrobiální ekologie zkoumána prostřednictvím experimentů a datových analýz, přičemž jsou využívány databáze vyvinuté laboratoří: GlobalFungi a GlobalAMFungi. Výzkum se také zaměřuje na rezistenci na antibiotika, ekofyziologii kvasinek a biogeografii.

Studované ekosystémy zahrnují lesy, travnaté porosty, arktickou tundru, zemědělská a antropogenní prostředí. Výzkum se snaží porozumět základním rolím mikroorganismů v prostředí, analyzovat a předpovídat účinky globálních změn a zkoumat vliv managementu ekosystémů na biodiverzitu a ekologické procesy.

Laboratoř spravuje Sbírku kultur bazidiomycet a nabízí služby v oblasti high-throughput sekvenování a bioinformatiky.

Co se u nás děje?

21. 8. 2024

Nová publikace: vliv rostlinných společenstev na bakteriální a houbová společenstva na středoevropských pastvinách

Zaměření výzkumu

« Swipněte pro zobrazení dalších záložek »

Vlivy těžby dřeva na půdní mikrobiom

Vlivy hospodaření na mikrobiální procesy

Vlivy holosečí na mikrobiologii půdy

Mikrobiální komunity na mrtvém dřevě

Biodiverzita a ekologie hub

Vlivy těžby dřeva na půdní mikrobiom

Ve spolupráci s Join Genome Institute a Environmental Molecular Sciences studujeme spolu s našimi německými a finskými spolupracovníky vlivy těžby dřeva na půdní mikrobiom za různých podmínek symbiózy kořenů rostlin a hub: v lesích s ektomykorhizní, erikoidní mykorhizní a arbuskulární mykorhizní symbiózou.

číst více

Vlivy hospodaření na mikrobiální procesy

V rámci projektu HoliSoils – „Holistické postupy řízení, modelování a monitorování pro evropské lesní půdy“, financovaného Evropskou unií v rámci programu Horizon, zkoumáme vlivy hospodaření a disturbancí, jako jsou požáry, odlesňování a sucho, na mikrobiální procesy a ukládání uhlíku v půdách.

číst více

Vlivy holosečí na mikrobiologii půdy

Spolu s našimi partnery z Lesnického institutu Slovinska hodnotíme vlivy selektivní těžby a holosečí na mikrobiologii půdy a regeneraci lesních porostů v krasových oblastech ve Slovinsku.

číst více

Mikrobiální komunity na mrtvém dřevě

Mrtvé dřevo je důležitým zásobníkem uhlíku a živin v lesních ekosystémech, zejména v přírodních lesích, kde se dřevo netěží. Náš výzkum se snaží pochopit principy vzniku, vývoje a fungování mikrobiálních komunit, které se vyvíjejí na rozkládajícím se dřevě a podporují jeho rozklad a recyklaci živin v rámci ekosystému.

číst více

Biodiverzita a ekologie hub

Pro zkoumání globální biodiverzity a ekologie hub naše skupina založila a udržuje databázi GlobalFungi, největší veřejně přístupnou databázi mikrobiálních komunit v přírodních stanovištích, která zahrnuje údaje z širokého spektra ekosystémů od terestrických až po oceánské sedimenty.

číst více