
Environmentální mikrobiologie
Baldrian lab
Výzkum zahrnuje ekologii, fyziologii a biochemii mikroorganismů (zejména hub a bakterií) v životním prostředí. Studovány jsou faktory ovlivňující mikrobiomy životního prostředí, fyziologie mikroorganismů v jejich přirozených stanovištích i v laboratorních kulturách a jejich podíl na ekosystémových procesech od jednotlivých vzorků až po globální úroveň. Na globální úrovni je mikrobiální ekologie zkoumána prostřednictvím experimentů a datových analýz, přičemž jsou využívány databáze vyvinuté laboratoří: GlobalFungi a GlobalAMFungi. Výzkum se také zaměřuje na rezistenci na antibiotika, ekofyziologii kvasinek a biogeografii.
Studované ekosystémy zahrnují lesy, travnaté porosty, arktickou tundru, zemědělská a antropogenní prostředí. Výzkum se snaží porozumět základním rolím mikroorganismů v prostředí, analyzovat a předpovídat účinky globálních změn a zkoumat vliv managementu ekosystémů na biodiverzitu a ekologické procesy.
Laboratoř spravuje Sbírku kultur bazidiomycet a nabízí služby v oblasti high-throughput sekvenování a bioinformatiky.

Co se u nás děje?

Zaměření výzkumu

Vlivy těžby dřeva na půdní mikrobiom
Ve spolupráci s Join Genome Institute a Environmental Molecular Sciences studujeme spolu s našimi německými a finskými spolupracovníky vlivy těžby dřeva na půdní mikrobiom za různých podmínek symbiózy kořenů rostlin a hub: v lesích s ektomykorhizní, erikoidní mykorhizní a arbuskulární mykorhizní symbiózou.
číst více
Vlivy hospodaření na mikrobiální procesy
V rámci projektu HoliSoils – „Holistické postupy řízení, modelování a monitorování pro evropské lesní půdy“, financovaného Evropskou unií v rámci programu Horizon, zkoumáme vlivy hospodaření a disturbancí, jako jsou požáry, odlesňování a sucho, na mikrobiální procesy a ukládání uhlíku v půdách.
číst více
Vlivy holosečí na mikrobiologii půdy
Spolu s našimi partnery z Lesnického institutu Slovinska hodnotíme vlivy selektivní těžby a holosečí na mikrobiologii půdy a regeneraci lesních porostů v krasových oblastech ve Slovinsku.
číst více
Mikrobiální komunity na mrtvém dřevě
Mrtvé dřevo je důležitým zásobníkem uhlíku a živin v lesních ekosystémech, zejména v přírodních lesích, kde se dřevo netěží. Náš výzkum se snaží pochopit principy vzniku, vývoje a fungování mikrobiálních komunit, které se vyvíjejí na rozkládajícím se dřevě a podporují jeho rozklad a recyklaci živin v rámci ekosystému.
číst více
Biodiverzita a ekologie hub
Pro zkoumání globální biodiverzity a ekologie hub naše skupina založila a udržuje databázi GlobalFungi, největší veřejně přístupnou databázi mikrobiálních komunit v přírodních stanovištích, která zahrnuje údaje z širokého spektra ekosystémů od terestrických až po oceánské sedimenty.
číst víceSlužby pro veřejnost a spolupráce
- Bayreuth University
- CEBAS CSIC, Murcia
- Helmholtz Centre for Environmental Research, Leipzig
- INRAE Nancy
- Institute of Molecular Biology, Sofia
- Natural Resources Institute Finland, Helsinki

Naše publikace
The latest trends in cryopreservation of fungi
Contribution of different bacterial groups in the carbon flow through the microbial food web
Náš tým
Seznamte se s členy našeho týmu Laboratoře environmentální mikrobiologie
Baldrian Lab