21. 8. 2024
Environmentální mikrobiologie
Baldrian lab
Výzkum zahrnuje ekologii, fyziologii a biochemii mikroorganismů (zejména hub a bakterií) v životním prostředí. Studovány jsou faktory ovlivňující mikrobiomy životního prostředí, fyziologie mikroorganismů v jejich přirozených stanovištích i v laboratorních kulturách a jejich podíl na ekosystémových procesech od jednotlivých vzorků až po globální úroveň. Na globální úrovni je mikrobiální ekologie zkoumána prostřednictvím experimentů a datových analýz, přičemž jsou využívány databáze vyvinuté laboratoří: GlobalFungi a GlobalAMFungi. Výzkum se také zaměřuje na rezistenci na antibiotika, ekofyziologii kvasinek a biogeografii.
Studované ekosystémy zahrnují lesy, travnaté porosty, arktickou tundru, zemědělská a antropogenní prostředí. Výzkum se snaží porozumět základním rolím mikroorganismů v prostředí, analyzovat a předpovídat účinky globálních změn a zkoumat vliv managementu ekosystémů na biodiverzitu a ekologické procesy.
Laboratoř spravuje Sbírku kultur bazidiomycet a nabízí služby v oblasti high-throughput sekvenování a bioinformatiky.
Co se u nás děje?
Zaměření výzkumu
« Swipněte pro zobrazení dalších záložek »
Vlivy těžby dřeva na půdní mikrobiom
Ve spolupráci s Join Genome Institute a Environmental Molecular Sciences studujeme spolu s našimi německými a finskými spolupracovníky vlivy těžby dřeva na půdní mikrobiom za různých podmínek symbiózy kořenů rostlin a hub: v lesích s ektomykorhizní, erikoidní mykorhizní a arbuskulární mykorhizní symbiózou.
číst více
Vlivy hospodaření na mikrobiální procesy
V rámci projektu HoliSoils – „Holistické postupy řízení, modelování a monitorování pro evropské lesní půdy“, financovaného Evropskou unií v rámci programu Horizon, zkoumáme vlivy hospodaření a disturbancí, jako jsou požáry, odlesňování a sucho, na mikrobiální procesy a ukládání uhlíku v půdách.
číst více
Vlivy holosečí na mikrobiologii půdy
Spolu s našimi partnery z Lesnického institutu Slovinska hodnotíme vlivy selektivní těžby a holosečí na mikrobiologii půdy a regeneraci lesních porostů v krasových oblastech ve Slovinsku.
číst více Mikrobiální komunity na mrtvém dřevě
Mrtvé dřevo je důležitým zásobníkem uhlíku a živin v lesních ekosystémech, zejména v přírodních lesích, kde se dřevo netěží. Náš výzkum se snaží pochopit principy vzniku, vývoje a fungování mikrobiálních komunit, které se vyvíjejí na rozkládajícím se dřevě a podporují jeho rozklad a recyklaci živin v rámci ekosystému.
číst více
Biodiverzita a ekologie hub
Pro zkoumání globální biodiverzity a ekologie hub naše skupina založila a udržuje databázi GlobalFungi, největší veřejně přístupnou databázi mikrobiálních komunit v přírodních stanovištích, která zahrnuje údaje z širokého spektra ekosystémů od terestrických až po oceánské sedimenty.
číst víceSlužby pro veřejnost a spolupráce
- Bayreuth University
- CEBAS CSIC, Murcia
- Helmholtz Centre for Environmental Research, Leipzig
- INRAE Nancy
- Institute of Molecular Biology, Sofia
- Natural Resources Institute Finland, Helsinki
Naše publikace
Ecology and Evolution. 2025; 15(4); e71352
Protein Coding Low-Copy rpb2 and ef1-alpha Regions Are Viable Fungal Metabarcoding DNA Markers Which Can Supplement ITS for Better Accuracy
Organic & Biomolecular Chemistry. 2025; 23(2); 449-460
Discovery of nostatin A; an azole-containing proteusin with prominent cytostatic and pro-apoptotic activity
Náš tým
Seznamte se s členy našeho týmu Laboratoře environmentální mikrobiologie
Baldrian Lab