Strukturní biologie a buněčné signalizace
Novák LAB
Naši skupinu tvoří multidisciplinární tým, jehož tematické zaměření je rozděleno do dvou hlavních směrů. Skupina strukturní biologie charakterizuje strukturu proteinů nebo proteinových komplexů a studuje jejich dynamiku s využitím pokročilých technik hmotnostní spektrometrie, jmenovitě technikami nativní hmotnostní spektrometrie, vodík-deuteriové výměny, radikálového nebo chemické značení proteinů a zesíťování proteinů. Protože tato data jsou poměrně složitá a existuje jen málo komerčních řešení pro jejich interpretaci, věnuje laboratoř část svého úsilí vývoji softwaru a psaní kódu. Skupina klinické proteomiky zkoumá původ různých druhů lidských patologií od bakteriálních/virových infekcí přes diabetes až po poruchu funkce ledvin a demenci. Hlavní předností tohoto týmu je unikátní „know-how“ výroby proteinových čipů pro imunoafinitní purifikaci. Tyto proteinové čipy jsou plně kompatibilní s hmotnostně-spektrometrickou detekcí.
Co se u nás děje?
Zadaným kriteriím neodpovídá žádná aktualita.
Zaměření výzkumu
Proteomika
Klinická diagnostika
Hmotnostní spektrometrie
Funkcionalizované povrchy pro hmotnostní spektrometrii
- imobilizace okolního iontu přistávacího proteinu
- povrchové Imunoafinitní substráty pro klinickou diagnostiku
- biochemicky aktivní destičky pro desorpční hmotnostní spektrometrii
Vodík-deuteriová výměna
Významné objevy, ocenění a úspěchy
Cena Vladimíra Hanuše Award 2023
2023 Zdeněk Kukačka
Fast Fluoroalkylation of Proteins Uncovers the Structure and Dynamics of Biological Macromolecules
Služby pro veřejnost a spolupráce
- Strukturní charakterizace interakce nových léčiv s jejich proteinovými cíli, validace produkce biologických terapeutik, kvantifikace mutantních forem proteinů v klinických vzorcích
- Bruker Daltonics, Nested Therapeutics, and VantAI.ai
- Yoni Haitin and Moshe Giladi, Tel Aviv University, Israel
- Daniele Fabris, University of Connecticut, Storrs, Connecticut, U.S.A.
- Charlotte Uetrecht, Centre for Structural Systems Biology, Hamburg, Germany
Náš tým
Seznamte se s členy našeho týmu Laboratoře strukturní biologie a buněčné signalizace
Novák Lab