Theme issue on the ecology of soil microorganisms FEMS Microbiology Ecology. 2024; 100(4); fiae0322024 Baldrian P.Pennanen T.Kohout P.Fritze H. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1093/femsec/fiae032
Fungal communities are passengers in community development of dune ecosystems; while bacteria are not Ecology. 2024; 105(6); ecy.43122024 Gao C.Bezemer T.van Bodegom P.Baldrian P.Kohout P.Mancinelli R.van der Hagen H.Soudzilovskaia N.Zobrazit další (3) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1002/ecy.4312
Effect of plant communities on bacterial and fungal communities in a Central European grassland Environmental Microbiome. 2024; 19(1); 422024 Lepinay C.Větrovský T.Chytrý M.Dřevojan P.Fajmon K.Cajthaml T.Kohout P.Baldrian P.Zobrazit další (3) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1186/s40793-024-00583-4
Plant effects on microbiome composition are constrained by environmental conditions in a successional grassland Environmental Microbiome. 2024; 19(1); 82024 Mészárošová L.Kuťáková E.Kohout P.Münzbergová Z.Baldrian P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1186/s40793-024-00550-z
Dominant herbaceous plants contribute to the spatial heterogeneity of beech and riparian forest soils by influencing fungal and bacterial diversity Soil Biology and Biochemistry. 2024; 193(June 2024); 1094052024 Zubek S.Rozek K.Chmolowska D.Odriozola Larranga I.Větrovský T.Skubała K.Thiago Dobbler P.Stefanowicz A.Stanek M.Orzechowska A.Kohout P.Baldrian P.Zobrazit další (7) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.soilbio.2024.109405
A cryptically diverse microbial community drives organic matter decomposition in forests Applied Soil Ecology. 2024; 193(January 24); 1051482024 Maillard F.Colin Y.Viotti C.Buee M.Brunner I.Brabcová V.Kohout P.Baldrian P.Kennedy P.Zobrazit další (4) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.apsoil.2023.105148
Current trends; limitations and future research in the fungi? Fungal Diversity. 2024; 125(1); 1-712024 Hyde K.Baldrian P.Chen Y.Chethana K.de Hoog S.Doilom M.Gomes de Farias A.Goncalves M.Gonkhom D.Gui H.Hilario S.Hu Y.Jayawardena R.Khyaju S.Kirk P.Kohout P.Luangharn T.Maharachchikumbura S.Manawasinghe I.Mortimer P.Niego A.Phonemany M.Sandargo B.Senanayake I.Stadler M.Surup F.Thongklang N.Wanasinghe D.Bahkali A.Walker A.Zobrazit další (25) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1007/s13225-023-00532-5
Connecting the multiple dimensions of global soil fungal diversity Science Advances. 2023; 9(48); eadj80162023 Mikryukov V.Dulya O.Zizka A.Bahram M.Hagh-Doust N.Anslan S.Prylutskyi O.Delgado-Baquerizo M.Maestre F.Nilsson H.Paern J.Oepik M.Moora M.Zobel M.Espenberg M.Mander Ü.Khalid A.Corrales A.Agan A.Vasco-Palacios A.Saitta A.Rinaldi A.Verbeken A.Sulistyo B.Tamgnoue B.Kohout P.Zobrazit další (21) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1126/sciadv.adj8016
Global Fungal Diversity Estimated from High-Throughput Sequencing In: PÖGGELE; S.; JAMES; T.; eds. Evolution of Fungi and Fungal-Like Organisms. Cham: Springer Nature; 2023; s. 227-238. The Mycota2023 Baldrian P.Kohout P.Větrovský T. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1007/978-3-031-29199-9_10
GlobalAMFungi: a global database of arbuscular mycorrhizal fungal occurrences from high-throughput sequencing metabarcoding studies New Phytologist. 2023; 240(5); 2151-21632023 Větrovský T.Kolaříková Z.Lepinay C.Awokunle Hollá S.Davison J.Fleyberková A.Gromyko A.Jelínková B.Kolařík M.Krüger M.Lejsková R.Michalčíková L.Michalová T.Moora M.Moravcová A.Moulíková .Odriozola Larranga I.Öpik M.Pappová M.Piche-Choquette S.Skřivánek J.Vlk L.Zobel M.Baldrian P.Kohout P.Zobrazit další (20) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/nph.19283
Improved recovery and annotation of genes in metagenomes through the prediction of fungal introns Molecular Ecology Resources. 2023; 23(8); 1800-18112023 Le A.Větrovský T.Baručić D.Saraiva J.Dobbler P.Kohout P.Pospíšek M.da Rocha U.Kléma J.Baldrian P.Zobrazit další (5) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/1755-0998.13852
Symbiotic status alters fungal eco-evolutionary offspring trajectories Ecology Letters. 2023; 26(9); 1523-15342023 Aguilar-Trigueros C.Krah F.Cornwell W.Zanne A.Abrego N.Anderson I.Andrew C.Baldrian P.Baessler C.Bissett A.Chaudhary V.Chen B.Chen Y.Delgado-Baquerizo M.Deveautour C.Egidi E.Flores-Moreno H.Golan J.Heilmann-Clausen J.Hempel S.Hu Y.Kauserud H.Kivlin S.Kohout P.Lammel D.Maestre F.Pringle A.Purhonen J.Singh B.Veresoglou S.Větrovský T.Zhang H.Rillig M.Powell J.Zobrazit další (29) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/ele.14271
Forest microbiome and global change Nature Reviews. Microbiology. 2023; 21(8); 487-5012023 Baldrian P.López Mondéjar R.Kohout P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1038/s41579-023-00876-4
Climate-driven shifts in plant and fungal communities can lead to topsoil carbon loss in alpine ecosystems FEMS Microbiology Ecology. 2023; 99(5); fiad0412023 Moravcová A.Barbi F.Brabcová V.Cajthaml T.Martinovič T.Soudzilovskaia N.Vlk L.Baldrian P.Kohout P.Zobrazit další (4) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1093/femsec/fiad041
Soil fungal and bacterial community structure in monocultures of fourteen tree species of the temperate zone Forest Ecology and Management. 2023; 530(15 February); 1207512023 Rozek K.Chmolowska D.Odriozola Larranga I.Větrovský T.Rola K.Kohout P.Baldrian P.Zubek S.Zobrazit další (3) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.foreco.2022.120751
Fungal communities in soils under global change Studies in Mycology. 2022; 103(21 September); 1-242022 Baldrian P.Bell-Dereske L.Lepinay C.Větrovský T.Kohout P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.3114/sim.2022.103.01
Closing the gap: examining the impact of source habitat proximity on plant and soil microbial communities in post-mining spoil heap succession Frontiers in Microbiology. 2024; 15(October 2); 14165152024 Mészárošová L.Kuťáková E.Kohout P.Münzbergová Z.Baldrian P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.3389/fmicb.2024.1416515
Phosphorus limitation promotes soil carbon storage in a boreal forest exposed to long-term nitrogen fertilization Global Change Biology. 2024;2024 Richy E.Fort T.Odriozola Larranga I.Kohout P.Barbi F.Martinovič T.Tupek B.Adamczyk B.Lehtonen A.Mäkipää R.Baldrian P.Zobrazit další (6) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/gcb.17516
Beyond the rootzone: Unveiling soil property and biota gradients around plants Science of the Total Environment. 2024; 949(1 November); 1750322024 Dostálek T.Rydlová J.Kohout P.Kuťáková E.Kolaříková Z.Frouz J.Muenzbergová Z.Zobrazit další (2) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.scitotenv.2024.175032
Accumulation of pathogens in soil microbiome can explain long-term fluctuations of legumes in a grassland community New Phytologist. 2024; 244(1); 235-2482024 Kohout P.Sudová R.Odriozola Larranga I.Kvasničková J.Petružálková M.Hadincová V.Krahulec F.Pecháčková S.Skálová H.Herben T.Zobrazit další (5) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/nph.20031
Defending Earth’s terrestrial microbiome Nature Microbiology. 2022; 7(11); 1717-17252022 Averill C.Anthony M.Baldrian P.Finkbeiner F.van den Hoogen J.Kiers T.Kohout P.Hirt E.Smith G.Crowther T.Zobrazit další (5) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1038/s41564-022-01228-3
Bacterial community in soil and tree roots of Picea abies shows little response to clearcutting FEMS Microbiology Ecology. 2022; 98(11); fiac1182022 Martinovič T.Kohout P.López Mondéjar R.Algora Gallardo C.Starke R.Tomšovský M.Baldrian P.Zobrazit další (2) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1093/femsec/fiac118
Global patterns in endemicity and vulnerability of soil fungi Global Change Biology. 2022; 28(22); 6696-67102022 Tedersoo L.Mikryukov V.Zizka A.Bahram M.Hagh-Doust N.Anslan S.Prylutskyi O.Delgado-Baquerizo M.Maestre F.Pärn J.Öpik M.Moora M.Zobel M.Espenberg M.Mander Ü.Khalid A.Corrales A.Agan A.Vasco-Palacios A.Saitta A.Rinaldi A.Verbeken A.Sulistyo B.Tamgnoue B.Furneaux B.Kohout P.Zobrazit další (21) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/gcb.16398
Asymmetric Interaction Between Two Mycorrhizal Fungal Guilds and Consequences for the Establishment of Their Host Plants Frontiers in Plant Science. 2022; 13(JUN 9 2022); 8732042022 Fernández N.Knoblochová T.Kohout P.Janoušková M.Cajthaml T.Frouz J.Rydlová J.Zobrazit další (2) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.3389/fpls.2022.873204
High-throughput sequencing view on the magnitude of global fungal diversity Fungal Diversity. 2022; 114(1); 539-5472022 Baldrian P.Větrovský T.Lepinay C.Kohout P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1007/s13225-021-00472-y
Changes in the root microbiome of four plant species with different mycorrhizal types across a nitrogen deposition gradient in ombrotrophic bogs Soil Biology and Biochemistry. 2022; 169(June 22); 1086732022 Boeraeve M.Kohout P.Ceulemans T.Cajthaml T.Tedersoo L.Jacquemyn H.Zobrazit další (1) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.soilbio.2022.108673
Soil microbial communities following 20 years of fertilization and crop rotation practices in the Czech Republic Environmental Microbiome. 2022; 17(1); 132022 Kráčmarová M.Uhlík O.Strejček M.Száková J.Černý J.Balík J.Tlustoš P.Kohout P.Demnerová K.Stiborová H.Zobrazit další (5) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1186/s40793-022-00406-4
Temporal turnover of the soil microbiome composition is guild-specific Ecology Letters. 2021; 24(12); 2726-27382021 Martinovič T.Odriozola Larranga I.Mašínová T.Bahnmann B.Kohout P.Sedlák P.Merunková K.Větrovský T.Tomšovský M.Ovaskainen O.Baldrian P.Zobrazit další (6) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/ele.13896
Response of soil fungal ecological guilds to global changes New Phytologist. 2021; 229(2); 656-6582021 Marin C.Kohout P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/nph.17054
Symbiosis of isoetid plant species with arbuscular mycorrhizal fungi under aquatic versus terrestrial conditions Mycorrhiza. 2021; 31(3); 273-2882021 Sudová R.Rydlová J.Čtvrtlíková M.Kohout P.Oehl F.Voříšková J.Kolaříková Z.Zobrazit další (2) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1007/s00572-020-01017-y
Predictors of soil fungal biomass and community composition in temperate mountainous forests in Central Europe Soil Biology and Biochemistry. 2021; 161(OCT 2021); 1083662021 Odriozola Larranga I.Navrátilová D.Tláskalová P.Klinerová T.Červenková Z.Kohout P.Větrovský T.Čížková P.Starý M.Baldrian P.Zobrazit další (5) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.soilbio.2021.108366
PacBio sequencing of Glomeromycota rDNA: a novel amplicon covering all widely used ribosomal barcoding regions and its applicability in taxonomy and ecology of arbuscular mycorrhizal fungi New Phytologist. 2021; 231(1); 490-4992021 Kolaříková Z.Slavíková R.Kruger A.Kruger C.Kohout P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/nph.17372
Temperature and pH define the realised niche space of arbuscular mycorrhizal fungi New Phytologist. 2021; 231(2); 763-7762021 Davison J.Moora M.Semchenko M.Kohout P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/nph.17240
Forest Microhabitat Affects Succession of Fungal Communities on Decomposing Fine Tree Roots Frontiers in Microbiology. 2021; 12(JAN 28 2021); 5415832021 Kohout P.Sudová R.Brabcová V.Vosolsobě S.Baldrian P.Albrechtová J.Zobrazit další (1) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.3389/fmicb.2021.541583
Early successional ectomycorrhizal fungi are more likely to naturalize outside their native range than other ectomycorrhizal fungi New Phytologist. 2020; 227(5); 1289-12932020 Vlk L.Tedersoo L.Antl T.Větrovský T.Abarenkov K.Pergl J.Albrechtová J.Vosátka M.Baldrian P.Pyšek P.Kohout P.Zobrazit další (6) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/nph.16557
Biotické ohrožení památek zahradního umění: řasy; sinice a invazní rostliny. Kritický katalog k výstavě 2020 Pergl J.Perglová I.Albrechtová J.Antl T.Abarenkov K.Baldrian P.Cihlářová L.Klečka J.Kohout P.Kvasničková J.Maršálek B.Maršálková E.Pejchal M.Petružálková M.Petřík P.Pyšek P.Sádlo J.Štefl L.Tedersoo L.Větrovský T.Vlk L.Vojík M.Vosátka M.Zezulka Š.Zobrazit další (19) Laboratoř environmentální mikrobiologie
Biotické ohrožení památek zahradního umění: řasy; sinice a invazní rostliny 2020 Pergl J.Perglová I.Albrechtová J.Antl T.Abarenkov K.Baldrian P.Cihlářová L.Klečka J.Kohout P.Kvasničková J.Maršálek B.Maršálková E.Pejchal M.Petružálková M.Petřík P.Pyšek P.Sádlo J.Štefl L.Tedersoo L.Větrovský T.Vlk L.Vojík M.Vosátka M.Zezulka Š.Zobrazit další (19) Laboratoř environmentální mikrobiologie
FungalTraits: a user-friendly traits database of fungi and fungus-like stramenopiles Fungal Diversity. 2020; 105(1); 1-162020 Polme S.Baldrian P.Kohout P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1007/s13225-020-00466-2
Stand age affects fungal community composition in a Central European temperate forest Fungal Ecology. 2020; 48(DEC2020); 1009852020 Odriozola Larranga I.Martinovič T.Bahnmann B.Ryšánek D.Mašínová T.Sedlák P.Merunková K.Kohout P.Tomšovský M.Baldrian P.Zobrazit další (5) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.funeco.2020.100985
Production of Fungal Mycelia in a Temperate Coniferous Forest Shows Distinct Seasonal Patterns Journal of Fungi. 2020; 6(4); 1902020 Štursová M.Kohout P.Human Z.Baldrian P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.3390/jof6040190
Alien ectomycorrhizal plants differ in their ability to interact with co-introduced and native ectomycorrhizal fungi in novel sites The ISME Journal. 2020; 14(9); 2336-23462020 Vlk L.Tedersoo L.Antl T.Větrovský T.Abarenkov K.Pergl J.Albrechtová J.Vosátka M.Baldrian P.Pyšek P.Kohout P.Zobrazit další (6) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1038/s41396-020-0692-5
Impact of trees and forests on the Devonian landscape and weathering processes with implications to the global Earth’s system properties A critical review Earth-Science Reviews. 2020; 205(June 2020); 1032002020 Pawlik L.Buma B.Šamonil P.Kvaček J.Galazka A.Kohout P.Malik I.Zobrazit další (2) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.earscirev.2020.103200
GlobalFungi; a global database of fungal occurrences from high-throughput-sequencing metabarcoding studies Scientific Data. 2020; 7(1); 2282020 Větrovský T.Morais D.Kohout P.Lepinay C.Algora C.Awokunle Hollá S.Bahnmann B.Bílohnědá K.Brabcová V.D'Alo F.Human Z.Jomura M.Kolařík M.Kvasničková J.Lladó S.López Mondéjar R.Martinovič T.Mašínová T.Mészárošová L.Michalčíková L.Michalová T.Mundra S.Navrátilová D.Odriozola Larranga I.Piche-Choquette S.Štursová M.Švec K.Tláskal V.Urbanová M.Vlk L.Voříšková J.Žifčáková L.Baldrian P.Zobrazit další (28) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1038/s41597-020-0567-7
Altered rhizoctonia assemblages in grasslands on ex-arable land support germination of mycorrhizal generalist; not specialist orchids New Phytologist. 2020; 227(4); 1200-12122020 Vogt-Schilb H.Těšitelová T.Kotilínek M.Sucháček P.Kohout P.Jersáková J.Zobrazit další (1) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/nph.16604
Diverse fungal communities associated with the roots of isoetid plants are structured by host plant identity Fungal Ecology. 2020; 45(JUNE 2020); 1009142020 Sudová R.Kohout P.Rydlová J.Čtvrtlíková M.Suda J.Voříšková J.Kolaříková Z.Zobrazit další (2) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.funeco.2020.100914
Diversity of fungi and bacteria in species-rich grasslands increases with plant diversity in shoots but not in roots and soil FEMS Microbiology Ecology. 2019; 95(1); fiy2082019 Navrátilová D.Tláskalová P.Kohout P.Dřevojan P.Fajmon K.Chytrý M.Baldrian P.Zobrazit další (2) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1093/femsec/fiy208
A meta-analysis of global fungal distribution reveals climate-driven patterns Nature Communications. 2019; 10(NOV 13); 51422019 Větrovský T.Kohout P.Kopecký M.Macháč A.Man M.Bahnmann B.Brabcová V.Choi J.Mészárošová L.Human Z.Lepinay C.Lladó S.López Mondéjar R.Martinovič T.Mašínová T.Morais D.Navrátilová D.Odriozola Larranga I.Štursová M.Švec K.Tláskal V.Urbanová M.Wan J.Žifčáková L.Howe A.Ladau J.Peay K.Storch D.Wild J.Baldrian P.Zobrazit další (25) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1038/s41467-019-13164-8
Ecology of mycorrhizas in the anthropocene Fungal Ecology. 2019; 40(SI); 1-32019 Jansa J.Kohout P. Laboratoř biologie hub10.1016/j.funeco.2019.02.012
