Quantitative Aspect of Bacillus subtilis ?B Regulatory Network on a Proteome Level—A Computational Simulation Biology. 2024; 13(8); 6142024 Vohradský J. Laboratoř bioinformatiky 10.3390/biology13080614
Whole proteome analysis of germinating and outgrowing Bacillus subtilis 168 Proteomics. 2024; č. článku 24000312024 Pospíšil J.Sax A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J. Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1002/pmic.202400031
A new role of sigma factors in regulation of bacterial transcription Czech Chem. Soc. Symp. Series. 2023; 21(5); 210-2102023 Pospíšil J.Schwarz M.Ziková A.Vítovská D.Hradilová M.Kolář M.Křenková A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J.Zobrazit další (5) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
?E of Streptomyces coelicolor can function both as a direct activator or repressor of transcription Communications Biology. 2024; 7(January 6); 462024 Pospíšil J.Schwarz M.Ziková A.Vítovská D.Hradilová M.Kolář M.Křenková A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J.Zobrazit další (5) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese /10.1038/s42003-023-05716-y
Quantitative Aspect of Bacillus subtilis ?B Regulatory Network—A Computational Simulation Biology. 2022; 11(12); 111217292022 Vohradský J. Laboratoř bioinformatiky 10.3390/biology11121729
rboAnalyzer webserver: web service for non-coding RNA characterization from NCBI BLAST output Bioinformatics. 2021; 37(17); 2755-27562021 Schwarz M.Vohradský J.Pánek J. Laboratoř bioinformatiky 10.1093/bioinformatics/btab073
Kinetic Modeling and Meta-Analysis of the Bacillus subtilis SigB Regulon during Spore Germination and Outgrowth Microorganisms. 2021; 9(1)2021 Vohradský J.Schwarz M.Ramaniuk O.Ruiz-Larrabeiti O.Vaňková Hausnerová V.Šanderová H.Krásný L.Zobrazit další (2) Laboratoř bioinformatiky 10.3390/microorganisms9010112
rboAnalyzer: A Software to Improve Characterization of Non-coding RNAs From Sequence Database Search Output Frontiers in genetics. 2020; 11(Jul 28); 6752020 Schwarz M.Vohradský J.Modrák M.Pánek J. Laboratoř bioinformatiky 10.3389/fgene.2020.00675
A Comparison of Protein and mRNA Expression during Development of the Soil Dwelling Prokaryote (S. coelicolor) Proteomics. 2020; 20(14); 20000322020 Pospíšil J.Strunin D.Ziková A.Hubálek M.Vohradský J. Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1002/pmic.202000032
rPredictorDB: a predictive database of individual secondary structures of RNAs and their formatted plots Database - The Journal of Biological Databases and Curation. 2019; 2019(APR 25); baz0472019 Jelínek J.Hoksza D.Hajič J.Pešek J.Drozen J.Hladík T.Klimpera M.Vohradský J.Pánek J.Zobrazit další (4) Laboratoř bioinformatiky 10.1093/database/baz047
DNA mapping and kinetic modeling of the HrdB regulon in Streptomyces coelicolor. Nucleic Acids Research. 2019; 47(2); 621-6332019 Šmídová K.Ziková A.Pospíšil J.Schwarz M.Bobek J.Vohradský J.Zobrazit další (1) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1093/nar/gky1018