Spatio-temporal control of asymmetric septum positioning during sporulation in Bacillus subtilis. Journal of Biological Chemistry. 2024; 300(6); 1073392024 Muchová K.Pospíšil J.Kalocsaiová E.Chromiková Z.Žarnovičanová S.Šanderová H.Krásný L.Barák I.Zobrazit další (3) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1016/j.jbc.2024.107339
Whole proteome analysis of germinating and outgrowing Bacillus subtilis 168 Proteomics. 2024; č. článku 24000312024 Pospíšil J.Sax A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J. Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1002/pmic.202400031
Structural characterization of two prototypical repressors of SorC family reveals tetrameric assemblies on DNA and mechanism of function. Nucleic Acids Research. 2024; 52(12); 7305-7320); gkae4342024 Šoltysová M.Škerlová J.Pachl P.Škubník K.Fábry M.Sieglová I.Farolfi M.Grishkovskaya I.Babiak M.Nováček J.Krásný L.Řezáčová P.Zobrazit další (7) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1093/nar/gkae434
RIP-seq reveals RNAs that interact with RNA polymerase and primary sigma factors in bacteria Nucleic Acids Research. 2024; 52(May 8); 4604-46262024 Vaňková Hausnerová V.Shoman M.Kumar D.Schwarz M.Modrák M.Jirát Matějčková J.Mikesková E.Neva S.Herrmannová A.Šiková M.Halada P.Novotná I.Pajer J.Valášek L.Převorovský M.Krásný L.Hnilicová J.Zobrazit další (12) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1093/nar/gkae081
A new role of sigma factors in regulation of bacterial transcription Czech Chem. Soc. Symp. Series. 2023; 21(5); 210-2102023 Pospíšil J.Schwarz M.Ziková A.Vítovská D.Hradilová M.Kolář M.Křenková A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J.Zobrazit další (5) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
Lipophosphonoxins; their preparation and use 2023 Rejman D.Pohl R.Mojr V.Do Pham D.Kolář M.Krásný L.Zobrazit další (1) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
?E of Streptomyces coelicolor can function both as a direct activator or repressor of transcription Communications Biology. 2024; 7(January 6); 462024 Pospíšil J.Schwarz M.Ziková A.Vítovská D.Hradilová M.Kolář M.Křenková A.Hubálek M.Krásný L.Vohradský J.Zobrazit další (5) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese /10.1038/s42003-023-05716-y
Design and synthesis of new molecular tools to probe cytosolic proteins in bacteria resistant to rifamycin antibiotics Czech Chemical Society Symposium Series. 2023; 21(5); 1792023 Mojr V.Sudzinová P.Hubálek M.Krásný L.Rejman D. Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
The alternative sigma factor SigN of Bacillus subtilis is intrinsically toxic Journal of Bacteriology. 2023; 205(10); e00112232023 Burton A.Pospíšilová D.Sudzinová P.Snider E.Burrage A.Krásný L.Kearns D.Zobrazit další (2) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1128/jb.00112-23
What the Hel: recent advances in understanding rifampicin resistance in bacteria FEMS Microbiology Reviews. 2023; 47(6); fuac0512023 Sudzinová P.Šanderová H.Koval T.Skálová T.Borah N.Hnilicová J.Kouba T.Dohnálek J.Krásný L.Zobrazit další (4) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1093/femsre/fuac051
Characterization of a transitionally occupied state and thermal unfolding of domain 1.1 of s(A) factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis Proteins-Structure; Function and Bioinformatics. 2023; 91(9); 1276-12872023 Tužinčin D.Padrta P.Šanderová H.Rabatinová A.Bendová K.Krásný L.Zídek L.Kadeřávek P.Zobrazit další (3) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1002/prot.26531
Bacterial resistance to rifampicin by its modifications Czech Chemical Society Symposium Series. 2022; 20(6); 380-3802022 Balgová T.Sudzinová P.Šanderová H.Rejman D.Krásný L. Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
Novel antibacterial compound lipophosphonoxins: design; synthesis; evaluation; and applications Czech Chemical Society Symposium Series. 2022; 20(6); 347-3472022 Do Pham D.Mojr V.Petrová M.Krásný L.Kolář M.Fišer R.Rejman D.Zobrazit další (2) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
Sweet life: what the antibiotic rifampicin and sugars have in common In: VYSKOČIL; V.; BAREK; J.; BENŠOVÁ; E.; DRAŠNAR; P.; HOLÝ; P.; CHUCHVALEC; P.; JURÁŠEK; M.; KOLSKÁ; Z.; KRATOCHVÍL; B.; MASÁK; J.; PODEŠVA; J.; ŠMEJKAL; P.; ŠVEC; F.; ŠÍMOVÁ; Š.; DIVÍŠEK; T.; eds. Czech Chem. Soc. Symp. Series - NIVB Meeting 2024. Praha: Česká společnost chemická/ Czech Chemical Society; 2024; s. 233-2332024 Wiedermannová J.Bobková .Rawat P.Plechatá M.Sudzinová P.Balgová T.Kameník Z.Krásný L.Zobrazit další (3) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
LEGO-Lipophosphonoxins: A Novel Approach in Designing Membrane Targeting Antimicrobials Journal of Medicinal Chemistry. 2022; 65(14); 10045-100782022 Do Pham D.Mojr V.Helusová M.Mikušová G.Pohl R.Dávidová E.Šanderová H.Vítovská D.Bogdanová K.Večeřová R.Sedláková M.Fišer R.Sudzinová P.Pospíšil J.Benada O.Křížek T.Galandáková A.Kolář M.Krásný L.Rejman D.Zobrazit další (15) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1021/acs.jmedchem.2c00684
Homologues of epigenetic pyrimidines: 5-alkyl-; 5-hydroxyalkyl and 5-acyluracil andcytosine nucleotides: synthesis; enzymatic incorporation into DNA and effect on transcription with bacterial RNA polymerase RSC Chemical Biology. 2022; 3(8); 1069-10752022 Gracias F.Ruiz-Larrabeiti O.Vaňková Hausnerová V.Pohl R.Klepetářová B.Sýkorová V.Krásný L.Hocek M.Zobrazit další (3) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1039/d2cb00133k
Epigenetic Pyrimidine Nucleotides in Competition with Natural dNTPs as Substrates for Diverse DNA Polymerases ACS Chemical Biology. 2022; 17(10); 2781-27882022 Pospíšil Š.Panattoni A.Gracias F.Sýkorová V.Vaňková Hausnerová V.Vítovská D.Šanderová H.Krásný L.Hocek M.Zobrazit další (4) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1021/acschembio.2c00342
Ms1 RNA Interacts With the RNA Polymerase Core in Streptomyces coelicolor and Was Identified in Majority of Actinobacteria Using a Linguistic Gene Synteny Search Frontiers in Microbiology. 2022; 13(MAY 11 2022); 8485362022 Vaňková Hausnerová V.Marvalová O.Šiková M.Shoman M.Havelková J.Kambová M.Janoušková M.Kumar D.Halada P.Schwarz M.Krásný L.Hnilicová J.Pánek J.Zobrazit další (8) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.3389/fmicb.2022.848536
Glucosylated 5-Hydroxymethylpyrimidines as Epigenetic DNA Bases Regulating Transcription and Restriction Cleavage Chemistry - A European Journal. 2022; 28(31); e2022009112022 Chakrapani A.Ruiz-Larrabeiti O.Pohl R.Svoboda M.Krásný L.Hocek M.Zobrazit další (1) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1002/chem.202200911
Lipofosfonoxiny třetí generace; jejich příprava a použití 2021 Rejman D.Pohl R.Mojr V.Do Pham D.Kolář M.Krásný L.Zobrazit další (1) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
Critical Reviews and Perspectives beta-CASP proteins removing RNA polymerase from DNA: when a torpedo is needed to shoot a sitting duck Nucleic Acids Research. 2021; 49(18); 10221-102342021 Wiedermannová J.Krásný L. Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1093/nar/gkab803
Novel lipophosphonoxin-loaded polycaprolactone electrospun nanofiber dressing reduces Staphylococcus aureus induced wound infection in mice Scientific Reports. 2021; 11(Sep); 176882021 Do Pham D.Jenčová V.Kaňuchová M.Bayram J.Grossová I.Šuca H.Urban L.Havlíčková K.Novotný V.Mikeš P.Mojr V.Asatiani N.Kuželová Košťáková E.Maixnerová M.Vlková A.Vítovská D.Šanderová H.Nemec A.Krásný L.Zajíček R.Lukáš D.Rejman D.Gál P.Zobrazit další (18) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1038/s41598-021-96980-7
Quasi-essentiality of RNase Y in Bacillus subtilis is caused by its critical role in the control of mRNA homeostasis Nucleic Acids Research. 2021; 49(12); 7088-71022021 Benda M.Woelfel S.Fasshauer P.Gunka K.Klumpp S.Poehlein A.Kálalová D.Šanderová H.Daniel R.Krásný L.Stuelke J.Zobrazit další (6) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1093/nar/gkab528
NAD-capping: a universal RNA modification in Mycobacteria; Archaea and Escherichia coli FEBS Open Bio. 2021; 11(Suppl 1); 182021 Ruiz-Larrabeiti O.Benoni R.Zemlianski V.Hanišáková N.Suder A.Schwarz M.Brezovská B.Svojanovská B.Vítězová M.Cahová H.Převorovský M.Krásný L.Zobrazit další (7) Laboratoř bioinformatiky
Kinetic Modeling and Meta-Analysis of the Bacillus subtilis SigB Regulon during Spore Germination and Outgrowth Microorganisms. 2021; 9(1)2021 Vohradský J.Schwarz M.Ramaniuk O.Ruiz-Larrabeiti O.Vaňková Hausnerová V.Šanderová H.Krásný L.Zobrazit další (2) Laboratoř bioinformatiky 10.3390/microorganisms9010112
Effects of DNA Topology on Transcription from rRNA Promoters in Bacillus subtilis Microorganisms. 2021; 9(1); 872021 Sudzinová P.Kambová M.Ramaniuk O.Benda M.Šanderová H.Krásný L.Zobrazit další (1) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.3390/microorganisms9010087
Mycobacterial HelD is a nucleic acids-clearing factor for RNA polymerase Nature Communications. 2020; 11(1); 64192020 Kouba T.Koval T.Sudzinová P.Pospíšil J.Brezovská B.Hnilicová J.Šanderová H.Janoušková M.Šiková M.Halada P.Sýkora M.Barvík I.Nováček J.Trundová M.Dušková J.Skálová T.Chon U.Murakami K.Dohnálek J.Krásný L.Zobrazit další (15) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1038/s41467-020-20158-4
Photocaged 5-(Hydroxymethyl)pyrimidine Nucleoside Phosphoramidites for Specific Photoactivatable Epigenetic Labeling of DNA Organic Letters. 2020; 22(22); 9081-90852020 Chakrapani A.Vaňková Hausnerová V.Ruiz-Larrabeiti O.Pohl R.Krásný L.Hocek M.Zobrazit další (1) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1021/acs.orglett.0c03462
Bacterial nanotubes as a manifestation of cell death Nature Communications. 2020; 11(1); 49632020 Pospíšil J.Vítovská D.Kofroňová O.Muchová K.Šanderová H.Hubálek M.Šiková M.Modrák M.Benada O.Barák I.Krásný L.Zobrazit další (6) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese Laboratoř charakterizace molekulární struktury10.1038/s41467-020-18800-2
Lipofosfonoxiny druhé generace a jejich použití 2020 Rejman D.Pohl R.Zborníková E.Krásný L.Látal T.Kolář M.Zobrazit další (1) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
The alarmones (p)ppGpp are part of the heat shock response of Bacillus subtilis PLoS Genetics. 2020; 16(3); e10082752020 Schafer H.Beckert B.Frese C.Steinchen W.Nuss A.Beckstette M.Hantke I.Driller K.Sudzinová P.Krásný L.Kaever V.Dersch P.Bange G.Wilson D.Turgay K.Zobrazit další (10) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1371/journal.pgen.1008275
The torpedo effect in Bacillus subtilis: RNase J1 resolves stalled transcription complexes EMBO Journal. 2020; 39(3); e1025002020 Šiková M.Wiedermannová J.Převorovský M.Barvík I.Sudzinová P.Kofroňová O.Benada O.Šanderová H.Condon C.Krásný L.Zobrazit další (5) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.15252/embj.2019102500
Evaluation of Second-Generation Lipophosphonoxins as Antimicrobial Additives in Bone Cement ACS Omega. 2020; 5(7); 3165-31712020 Zborníková E.Gallo J.Večeřová R.Bogdanová K.Kolář M.Vítovská D.Do Pham D.Pačes O.Mojr V.Šanderová H.Ulrichová J.Galandáková A.Čadek D.Hrdlička Z.Krásný L.Rejman D.Zobrazit další (11) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1021/acsomega.9b03072
Dinucleoside polyphosphates act as 5?-RNA caps in bacteria Nature Communications. 2020; 11(Feb 26); 10522020 Hudeček O.Benoni R.Reyes Gutierrez P.Culka M.Šanderová H.Hubálek M.Rulíšek L.Cvačka J.Krásný L.Cahová H.Zobrazit další (5) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1038/s41467-020-14896-8
Lipophosphonoxins of second generation; and their use 2019 Rejman D.Pohl R.Zborníková E.Krásný L.Látal T.Kolář M.Zobrazit další (1) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese
Quantitative Conformational Analysis of Functionally Important Electrostatic Interactions in the Intrinsically Disordered Region of Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase Journal of the American Chemical Society. 2019; 141(42); 16817-168282019 Kubáň V.Srb P.Štégnerová H.Padrta P.Zachrdla M.Jeseňáková Z.Šanderová H.Vítovská D.Krásný L.Koval T.Dohnálek J.Ziemska-Legiecka J.Grynberg M.Jarnot P.Gruca A.Jensen M.Blackledge M.Žídek L.Zobrazit další (13) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1021/jacs.9b07837
Analysis of nucleotide pools in bacteria using HPLC-MS in HILIC mode Talanta. 2019; 205(Dec 1); 1201612019 Zborníková E.Knejzlík Z.Hauryliuk V.Krásný L.Rejman D. Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1016/j.talanta.2019.120161
Switching transcription with bacterial RNA polymerase through photocaging; photorelease and phosphorylation reactions in the major groove of DNA Chemical Science. 2019; 10(14); 3937-39422019 Vaníková Z.Janoušková M.Kambová M.Krásný L.Hocek M. Laboratoř buněčné biologie infekcí 10.1039/c9sc00205g
Domain structure of HelD; an interaction partner of Bacillus subtilis RNA polymerase FEBS Letters. 2019; 593(9); 996-10052019 Koval T.Sudzinová P.Perháčová T.Trundová M.Skálová T.Fejfarová K.Šanderová H.Krásný L.Dušková J.Dohnálek J.Zobrazit další (5) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1002/1873-3468.13385
Ms1 RNA increases the amount of RNA polymerase in Mycobacterium smegmatis Molecular Microbiology. 2019; 111(2); 354-3722019 Šiková M.Janoušková M.Ramaniuk O.Páleníková P.Pospíšil J.Bartl P.Suder A.Pajer P.Kubičková P.Pavliš O.Hradilová M.Vítovská D.Šanderová H.Převorovský M.Hnilicová J.Krásný L.Zobrazit další (11) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1111/mmi.14159
The Core and Holoenzyme Forms of RNA Polymerase from Mycobacterium smegmatis Journal of Bacteriology. 2019; 201(4); e005832019 Kouba T.Pospíšil J.Hnilicová J.Šanderová H.Barvík I.Krásný L.Zobrazit další (1) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1128/JB.00583-18
Spx; the central regulator of the heat and oxidative stress response in B-subtilis; can repress transcription of translation-related genes Molecular Microbiology. 2019; 111(2); 514-5332019 Schaefer H.Heinz A.Sudzinová P.Voss M.Hantke I.Krásný L.Turgay K.Zobrazit další (2) Laboratoř mikrobiální genetiky a genové exprese 10.1111/mmi.14171
