Structural Characterization of Monoclonal Antibodies and Epitope Mapping by FFAP Footprinting Analytical Chemistry. 2024; 96(19); 7386-73932024 Fojtík L.Kalaninová Z.Fiala J.Halada P.Chmelík J.Man P.Kukačka Z.Novák P.Zobrazit další (3) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1021/acs.analchem.3c04161
Structural dynamics of Na+ and Ca2+ interactions with full-size mammalian NCX Communications Biology. 2024; 7(1); 4632024 Giladi M.Fojtík L.Strauss T.Da'adoosh B.Hiller R.Man P.Khananshvili D.Zobrazit další (2) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1038/s42003-024-06159-9
Probing Antibody Structures by Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry In: GEVAERT; K.; ed. Mass Spectrometry-Based Proteomics. New York: Humana; 2023; s. 303-334. Methods in Molecular Biology2023 Kalaninová Z.Fojtík L.Chmelík J.Novák P.Volný M.Man P.Zobrazit další (1) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1007/978-1-0716-3457-8_17
Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry of Heme-Based Oxygen Sensor Proteins In: WEINERT; E.E.; ed. Oxygen Sensing. Methods and Protocols. New York: Humana; 2023; s. 99-1222023 Vávra J.Sergunin A.Stráňava M.Kádek A.Shimitzu T.Man P.Martínková M.Zobrazit další (2) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1007/978-1-0716-3080-8_8
A conserved tryptophan in the acylated segment of RTX toxins controls their ?inf2/inf integrin–independent cell penetration Journal of Biological Chemistry. 2023; 299(8); 1049782023 Osičková A.Knoblochová Š. Warning: Uninitialized string offset 0 in /www/doc/mbu.cas.cz/www/wp-content/themes/mbu/template-parts/loop-publication.php on line 70 .Man P.Kalaninová Z.Lepesheva A.Jurnečka D.Čížková M.Biedermannová L.Goldsmith J.Maynard J.McLellan J.Osička R.Šebo P.Mašín J.Zobrazit další (10) Laboratoř molekulární biologie bakteriálních patogenů 10.1016/j.jbc.2023.104978
Counterintuitive structural and functional effects due to naturally occurring mutations targeting the active site of the disease-associated NQO1 enzyme FEBS Journal. 2023; 290(7); 1855-18732023 Pacheco-Garcia J.Anoz-Carbonell E.Loginov D.Kavan D.Salido E.Man P.Medina M.Pey A.Zobrazit další (3) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1111/febs.16677
Insights into the pathogenesis of primary hyperoxaluria type I from the structural dynamics of alanine:glyoxylate aminotransferase variants FEBS Letters. 2024; 598(4); 485-4992024 Vaňková P.Pacheco-Garcia J.Loginov D.Gomez-Mulas A.Kádek A.Martin-Garcia J.Salido E.Man P.Pey A.Zobrazit další (4) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1002/1873-3468.14800
A single evolutionarily divergent mutation determines the different FAD-binding affinities of human and rat NQO1 due to site-specific phosphorylation FEBS Letters. 2022; 596(1); 29-412022 Luis Pacheco-Garcia J.Loginov D.Rizzuti B.Vaňková P.Neira J.Kavan D.Mesa-Torres N.Guzzi R.Man P.Pey A.Zobrazit další (5) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1002/1873-3468.14238
Allosteric Communication in the Multifunctional and Redox NQO1 Protein Studied by Cavity-Making Mutations Antioxidants. 2022; 11(6); 11102022 Pacheco-Garcia J.Loginov D.Anoz-Carbonell E.Vaňková P.Palomino-Morales R.Salido E.Man P.Medina M.Naganathan A.Pey A.Zobrazit další (5) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.3390/antiox11061110
Different phenotypic outcome due to site-specific phosphorylation in the cancer-associated NQO1 enzyme studied by phosphomimetic mutations Archives of Biochemistry and Biophysics. 2022; 729(OCT 30 2022); 1093922022 Pacheco-Garcia J.Anoz-Carbonell E.Loginov D.Vaňková P.Salido E.Man P.Medina M.Palomino-Morales R.Pey A.Zobrazit další (4) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1016/j.abb.2022.109392
Loss of stability and unfolding cooperativity in hPGK1 upon gradual structural perturbation of its N-terminal domain hydrophobic core Scientific Reports. 2022; 12(1); 172002022 Luis Pacheco-Garcia J.Loginov D.Naganathan A.Vaňková P.Cano-Munoz M.Man P.Pey A.Zobrazit další (2) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1038/s41598-022-22088-1
TTYH family members form tetrameric complexes at the cell membrane Communications Biology. 2022; 5(1); 8862022 Melvin E.Kalaninová Z.Shlush E.Man P.Giladi M.Haitin Y.Zobrazit další (1) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1038/s42003-022-03862-3
Structural basis for long-chain isoprenoid synthesis by cis-prenyltransferases Science Advances. 2022; 8(20); eabn11712022 Giladi M.Bar-El M.Vaňková P.Ferofontov A.Melvin E.Alkaderi S.Kavan D.Redko B.Haimov E.Wiener R.Man P.Haitin Y.Zobrazit další (7) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1126/sciadv.abn1171
Early modification of cytochrome c by hydrogen peroxide triggers its fast degradation International Journal of Biological Macromolecules. 2021; 174(MAR 31 2021); 413-4232021 Tomášková N.Novák P.Kožár T.Petrenčáková M.Jančura D.Yassaghi G.Man P.Sedlák E.Zobrazit další (3) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1016/j.ijbiomac.2021.01.189
Structural basis of the pleiotropic and specific phenotypic consequences of missense mutations in the multifunctional NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1 and their pharmacological rescue Redox Biology. 2021; 46(OCT 2021); 1021122021 Pacheco-Garcia J.Anoz-Carbonell E.Vaňková P.Kannan A.Palomino-Morales R.Mesa-Torres N.Salido E.Man P.Medina M.Naganathan A.Pey A.Zobrazit další (6) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1016/j.redox.2021.102112
Functional expression and characterization of two laccases from the brown rot Fomitopsis pinicola Enzyme and Microbial Technology. 2021; 148(AUG 2021); 1098012021 Csarman F.Obermann T.Zanjko M.Man P.Halada P.Seiboth B.Ludwig R.Zobrazit další (2) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1016/j.enzmictec.2021.109801
Chimeric Cellobiose Dehydrogenases Reveal the Function of Cytochrome Domain Mobility for the Electron Transfer to Lytic Polysaccharide Monooxygenase ACS Catalysis. 2021; 11(2); 517-5322021 Felice A.Schuster C.Kádek A.Filandr F.Laurent C.Scheiblbrandner S.Schwaiger L.Schachinger F.Kracher D.Sygmund C.Man P.Halada P.Oostenbrink C.Ludwig R.Zobrazit další (9) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1021/acscatal.0c05294
Studying Protein-DNA Interactions by Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry In: POTERSZMAN; Arnaud; ed. Multiprotein Complexes. Methods and Protocols. 2247. New York: Springer; 2021; s. 193-219. Methods in Molecular Biology2021 Filandrová R.Kavan D.Kádek A.Novák P.Man P. Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1007/978-1-0716-1126-5_11
Different Reaction Specificities of F420H2-Dependent Reductases Facilitate Pyrrolobenzodiazepines and Lincomycin To Fit Their Biological Targets Journal of the American Chemical Society. 2020; 142(7); 3440-34482020 Steiningerová L.Kameník Z.Gažák R.Kadlčík S.Bashiri G.Man P.Kuzma M.Pavlíková M.Janata J.Zobrazit další (4) Laboratoř Antibiotické rezistence a mikrobiální metabolomiky10.1021/jacs.9b11234
HSPA1A conformational mutants reveal a conserved structural unit in Hsp70 proteins Biochimica et Biophysica Acta-General Subjects. 2020; 1864(1); 1294582020 Vandová V.Vaňková P.Durech M.Houser J.Kavan D.Man P.Muller P.Trčka F.Zobrazit další (3) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1016/j.bbagen.2019.129458
The interaction of the mitochondrial protein importer TOMM34 with HSP70 is regulated by TOMM34 phosphorylation and binding to 14-3-3 adaptors Journal of Biological Chemistry. 2020; 295(27); 8928-89442020 Trčka F.Durech M.Vaňková P.Vandová V.Šimončík O.Kavan D.Vojtěšek B.Muller P.Man P.Zobrazit další (4) Laboratoř regulace genové exprese10.1074/jbc.RA120.012624
Bacteriocin ASM1 is an O/S-diglycosylated; plasmid-encoded homologue of glycocin F FEBS Letters. 2020; 594(7); 1196-12062020 Main P.Hata T.Loo T.Man P.Novák P.Havlíček V.Norris G.Patchett M.Zobrazit další (3) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1002/1873-3468.13708
Photoinduced damage of AsLOV2 domain is accompanied by increased singlet oxygen production due to flavin dissociation Scientific Reports. 2020; 10(1); 41192020 Petrenčáková M.Filandr F.Hovan A.Yassaghi G.Man P.Kožár T.Schwer M.Jančura D.Pluckthun A.Novák P.Miškovský P.Bano G.Sedlák E.Zobrazit další (8) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1038/s41598-020-60861-2
The H2O2-dependent activity of a fungal lytic polysaccharide monooxygenase investigated with a turbidimetric assay Biotechnology for Biofuels. 2020; 13(1); 372020 Filandr F.Man P.Halada P.Chang H.Ludwig R.Kracher D.Zobrazit další (1) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1186/s13068-020-01673-4
Structural basis of heterotetrameric assembly and disease mutations in the human cis-prenyltransferase complex Nature Communications. 2020; 11(1); 52732020 Bar-El Lisnyansky M.Vaňková P.Yeheskel A.Simhaev L.Engel H.Man P.Haitin Y.Giladi M.Zobrazit další (3) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1038/s41467-020-18970-z
Conserved cysteine dioxidation enhances membrane interaction of human Cl(-)intracellular channel 5 FASEB Journal. 2020; 34(8); 9925-99402020 Ferofontov A.Vaňková P.Man P.Giladi M.Haitin Y. Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1096/fj.202000399R
Structural Dynamics of Lytic Polysaccharide Monooxygenase during Catalysis Biomolecules. 2020; 10(2); 2422020 Filandr F.Kavan D.Kracher D.Laurent C.Ludwig R.Man P.Halada P.Zobrazit další (2) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.3390/biom10020242
14-3-3 protein binding blocks the dimerization interface of caspase-2 FEBS Journal. 2020; 287(16); 3494-35102020 Kalábová D.Filandr F.Alblová M.Petrvalská O.Horváth M.Man P.Obšil T.Obšilová V.Zobrazit další (3) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1111/febs.15215
A Dynamic Core in Human NQO1 Controls the Functional and Stability Effects of Ligand Binding and Their Communication across the Enzyme Dimer Biomolecules. 2019; 9(11); 7282019 Vaňková P.Salido E.Timson D.Man P.Pey A. Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.3390/biom9110728
MS-Based Approaches Enable the Structural Characterization of Transcription Factor/DNA Response Element Complex Biomolecules. 2019; 9(10); 5352019 Slavata L.Chmelík J.Kavan D.Filandrová R.Fiala J.Rosůlek M.Mrázek H.Kukačka Z.Vališ K.Man P.Miller M.McIntyre W.Fabris D.Novák P.Zobrazit další (9) Laboratoř charakterizace molekulární struktury10.3390/biom9100535
Recommendations for performing; interpreting and reporting hydrogen deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) experiments Nature Methods. 2019; 16(7); 595-6022019 Masson G.Burke J.Ahn N.Anand G.Borchers C.Brier S.Bou-Assaf G.Engen J.Englander S.Faber J.Garlish R.Griffin P.Gross M.Guttman M.Hamuro Y.Heck A.Houde D.Iacob R.Jorgensen T.Kaltashov I.Klinman J.Konermann L.Man P.Mayne L.Pascal B.Reichmann D.Skehel M.Snijder J.Strutzenberg T.Underbakke E.Wagner C.Wales T.Walters B.Weis D.Wilson D.Wintrode P.Zhang Z.Zheng J.Schriemer D.Rand K.Zobrazit další (35) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1038/s41592-019-0459-y
Improving the Sequence Coverage of Integral Membrane Proteins during Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry Experiments Analytical Chemistry. 2019; 91(17); 10970-109782019 Moller I.Slivacka M.Hausner J.Nielsen A.Pospíšilová E.Merkle P.Lišková R.Polák M.Loland C.Kádek A.Man P.Rand K.Zobrazit další (7) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1021/acs.analchem.9b00973
A three-pronged ‘Pitchfork’ strategy enables an extensive description of the human membrane proteome and the identification of missing proteins Journal of Proteomics. 2019; 204(JUL 30); 1034112019 Vít O.Harant K.Klener P.Man P.Petrák J. Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1016/j.jprot.2019.103411
Ergochromes: Heretofore Neglected Side of Ergot Toxicity Toxins. 2019; 11(8); 4392019 Flieger M.Stodůlková E.Wyka S.Černý J.Grobárová V.Píchová K.Novák P.Man P.Kuzma M.Cvak L.Broders K.Kolařík M.Zobrazit další (7) Laboratoř genetiky a metabolismu hub10.3390/toxins11080439
Thiopurine intolerance-causing mutations in NUDT15 induce temperature-dependent destabilization of the catalytic site Biochimica Et Biophysica Acta-Proteins and Proteomics. 2019; 1867(4); 376-3812019 Man P.Fábry M.Sieglová I.Kavan D.Novák P.Hnízda A.Zobrazit další (1) Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace 10.1016/j.bbapap.2019.01.006
Human Stress-inducible Hsp70 Has a High Propensity to Form ATP-dependent Antiparallel Dimers That Are Differentially Regulated by Cochaperone Binding Molecular & Cellular Proteomics. 2019; 18(2); 320-3372019 Trčka F.Ďurech M.Vaňková P.Chmelík J.Martínková V.Hausner J.Kádek A.Marcoux J.Klumpler T.Vojtěšek B.Müller P.Man P.Zobrazit další (7) Laboratoř regulace genové exprese10.1074/mcp.RA118.001044
