Effect of plant communities on bacterial and fungal communities in a Central European grassland Environmental Microbiome. 2024; 19(1); 422024 Lepinay C.Větrovský T.Chytrý M.Dřevojan P.Fajmon K.Cajthaml T.Kohout P.Baldrian P.Zobrazit další (3) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1186/s40793-024-00583-4
Dominant herbaceous plants contribute to the spatial heterogeneity of beech and riparian forest soils by influencing fungal and bacterial diversity Soil Biology and Biochemistry. 2024; 193(June 2024); 1094052024 Zubek S.Rozek K.Chmolowska D.Odriozola Larranga I.Větrovský T.Skubała K.Thiago Dobbler P.Stefanowicz A.Stanek M.Orzechowska A.Kohout P.Baldrian P.Zobrazit další (7) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.soilbio.2024.109405
Fungal symbionts associate with holm oak tree health in declining oak savannas of the southwest of the Iberian Peninsula Applied Soil Ecology. 2024; 195(March 24); 1052102024 Garrastatxu J.Odriozola Larranga I.Esteban R.Encinas-Valero M.Morais D.Větrovský T.Yuste J.Zobrazit další (2) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.apsoil.2023.105210
Decomposition of Fomes fomentatius fruiting bodies –transition of healthy living fungus into a deca y ed bacteria-ric h ha bita t is primaril y dri v en by Arthropoda FEMS Microbiology Ecology. 2024; 100(5); fiae0442024 Bosch J.Dobbler P.Větrovský T.Tláskal V.Baldrian P.Brabcová V.Zobrazit další (1) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1093/femsec/fiae044
Exploring structural and molecular diversity of Ericaceae hair root mycobionts: a comparison between Northern Bohemia and Argentine Patagonia Mycorrhiza. 2023; 33(5-6); 425-4472023 Vohník M.Bruzone M.Knoblochová T.Fernández N.Kolaříková Z.Větrovský T.Fontenla S.Zobrazit další (2) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1007/s00572-023-01125-5
Global Fungal Diversity Estimated from High-Throughput Sequencing In: PÖGGELE; S.; JAMES; T.; eds. Evolution of Fungi and Fungal-Like Organisms. Cham: Springer Nature; 2023; s. 227-238. The Mycota2023 Baldrian P.Kohout P.Větrovský T. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1007/978-3-031-29199-9_10
Continuous microhabitats as crossroads of fungal communities in a primeval temperate forest Soil Biology and Biochemistry. 2023; 187(December 2023); 1091872023 Piche-Choquette S.Tláskal V.Vrška T.Jiráska L.Větrovský T.Baldrian P.Zobrazit další (1) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.soilbio.2023.109187
GlobalAMFungi: a global database of arbuscular mycorrhizal fungal occurrences from high-throughput sequencing metabarcoding studies New Phytologist. 2023; 240(5); 2151-21632023 Větrovský T.Kolaříková Z.Lepinay C.Awokunle Hollá S.Davison J.Fleyberková A.Gromyko A.Jelínková B.Kolařík M.Krüger M.Lejsková R.Michalčíková L.Michalová T.Moora M.Moravcová A.Moulíková .Odriozola Larranga I.Öpik M.Pappová M.Piche-Choquette S.Skřivánek J.Vlk L.Zobel M.Baldrian P.Kohout P.Zobrazit další (20) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/nph.19283
Improved recovery and annotation of genes in metagenomes through the prediction of fungal introns Molecular Ecology Resources. 2023; 23(8); 1800-18112023 Le A.Větrovský T.Baručić D.Saraiva J.Dobbler P.Kohout P.Pospíšek M.da Rocha U.Kléma J.Baldrian P.Zobrazit další (5) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/1755-0998.13852
A pile of pipelines: An overview of the bioinformatics software for metabarcoding data analyses Molecular Ecology Resources. 2023;2023 Hakimzadeh A.Abdala Asbun A.Albanese D.Bernard M.Buchner D.Callahan B.Caporaso J.Curd E.Djemiel C.Brandstrom Durling M.Elbrecht V.Gold Z.Gweon H.Hajibabaei M.Hildebrand F.Mikryukov V.Normandeau E.Ozkurt E.M. Palmer J.Pascal G.Porter T.Straub D.Vasar M.Větrovský T.Zafeiropoulos H.Anslan S.Zobrazit další (21) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/1755-0998.13847
Impact of Wood Age on Termite Microbial Assemblages Applied and Environmental Microbiology. 2023; 89(5); e00361232023 Chakraborty A.Šobotník J.Votýpková K.Hradecký J.Stiblik P.Synek J.Bourguignon T.Baldrian P.Engel M.Novotný V.Odriozola Larranga I.Větrovský T.Zobrazit další (7) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1128/aem.00361-23
Symbiotic status alters fungal eco-evolutionary offspring trajectories Ecology Letters. 2023; 26(9); 1523-15342023 Aguilar-Trigueros C.Krah F.Cornwell W.Zanne A.Abrego N.Anderson I.Andrew C.Baldrian P.Baessler C.Bissett A.Chaudhary V.Chen B.Chen Y.Delgado-Baquerizo M.Deveautour C.Egidi E.Flores-Moreno H.Golan J.Heilmann-Clausen J.Hempel S.Hu Y.Kauserud H.Kivlin S.Kohout P.Lammel D.Maestre F.Pringle A.Purhonen J.Singh B.Veresoglou S.Větrovský T.Zhang H.Rillig M.Powell J.Zobrazit další (29) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/ele.14271
Defining the relationship between phylogeny; clinical manifestation; and phenotype for Trichophyton mentagrophytes/interdigitale complex; a literature review and taxonomic recommendations Medical Mycology. 2023; 61(5); myad0422023 Švarcová M.Větrovský T.Kolařík M.Hubka V. Laboratoř genetiky a metabolismu hub10.1093/mmy/myad042
Soil fungal and bacterial community structure in monocultures of fourteen tree species of the temperate zone Forest Ecology and Management. 2023; 530(15 February); 1207512023 Rozek K.Chmolowska D.Odriozola Larranga I.Větrovský T.Rola K.Kohout P.Baldrian P.Zubek S.Zobrazit další (3) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.foreco.2022.120751
Fungal communities in soils under global change Studies in Mycology. 2022; 103(21 September); 1-242022 Baldrian P.Bell-Dereske L.Lepinay C.Větrovský T.Kohout P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.3114/sim.2022.103.01
High-throughput sequencing view on the magnitude of global fungal diversity Fungal Diversity. 2022; 114(1); 539-5472022 Baldrian P.Větrovský T.Lepinay C.Kohout P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1007/s13225-021-00472-y
Composition and functioning of the soil microbiome in the highest altitudes of the Italian Alps and potential effects of climate change FEMS Microbiology Ecology. 2022; 98(3); fiac0252022 D'Alo F.Baldrian P.Odriozola Larranga I.Morais D.Větrovský T.Zucconi L.Ripa C.Cannone N.Malfasi F.Onofri S.Zobrazit další (5) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1093/femsec/fiac025
Functional soil mycobiome across ecosystems Journal of Proteomics. 2022; 252(FEB 10 2022); 1044282022 Fernandes M.Bastida F.Jehmlich N.Martinovič T.Větrovský T.Baldrian P.Delgado-Baquerizo M.Starke R.Zobrazit další (3) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.jprot.2021.104428
Temporal turnover of the soil microbiome composition is guild-specific Ecology Letters. 2021; 24(12); 2726-27382021 Martinovič T.Odriozola Larranga I.Mašínová T.Bahnmann B.Kohout P.Sedlák P.Merunková K.Větrovský T.Tomšovský M.Ovaskainen O.Baldrian P.Zobrazit další (6) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/ele.13896
Predictors of soil fungal biomass and community composition in temperate mountainous forests in Central Europe Soil Biology and Biochemistry. 2021; 161(OCT 2021); 1083662021 Odriozola Larranga I.Navrátilová D.Tláskalová P.Klinerová T.Červenková Z.Kohout P.Větrovský T.Čížková P.Starý M.Baldrian P.Zobrazit další (5) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.soilbio.2021.108366
Large subglacial source of mercury from the southwestern margin of the Greenland Ice Sheet Nature Geoscience. 2021; 14(7); 496-5022021 Hawkings J.Linhoff B.Wadham J.Stibal M.Lamborg C.Carling G.Lamarche-Gagnon G.Kohler T.Ward R.Hendry K.Falteisek L.Kellerman A.Cameron K.Hatton J.Tingey S.Holt A.Vinšová P.Hofer S.Bulínová M.Větrovský T.Meire L.Spencer R.Zobrazit další (17) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1038/s41561-021-00753-w
Metagenomes; metatranscriptomes and microbiomes of naturally decomposing deadwood Scientific Data. 2021; 8(1); 1982021 Tláskal V.Brabcová V.Větrovský T.López Mondéjar R.Monteiro L.Saraiva J.da Rocha U.Baldrian P.Zobrazit další (3) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1038/s41597-021-00987-8
Complementary Roles of Wood-Inhabiting Fungi and Bacteria Facilitate Deadwood Decomposition mSystems. 2021; 6(1); e01078-202021 Tláskal V.Brabcová V.Větrovský T.Jomura M.López Mondéjar R.Monteiro L.Saraiva J.Human Z.Cajthaml T.da Rocha U.Baldrian P.Zobrazit další (6) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1128/mSystems.01078-20
Fungal Communities Are Important Determinants of Bacterial Community Composition in Deadwood mSystems. 2021; 6(1); e01017-202021 Odriozola Larranga I.Abrego N.Tláskal V.Zrůstová P.Morais D.Větrovský T.Ovaskainen O.Baldrian P.Zobrazit další (3) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1128/mSystems.01017-20
Niche differentiation of bacteria and fungi in carbon and nitrogen cycling of different habitats in a temperate coniferous forest: A metaproteomic approach Soil Biology and Biochemistry. 2021; 155(APR 2021); 1081702021 Starke R.López Mondéjar R.Human Z.Navrátilová D.Štursová M.Větrovský T.Olson H.Orton D.Callister S.Lipton M.Howe A.McCue L.Pennacchio C.Grigoriev I.Baldrian P.Zobrazit další (10) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.soilbio.2021.108170
Termites Are Associated with External Species-Specific Bacterial Communities Applied and Environmental Microbiology. 2021; 87(2); e02042-202021 Soukup P.Větrovský T.Stiblik P.Votýpková K.Chakraborty A.Sillam-Dusses D.Kolařík M.Odriozola Larranga I.Lo N.Baldrian P.Šobotník J.Bourguignon T.Zobrazit další (7) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1128/AEM.02042-20
R/G Value-A Numeric Index of Individual Periodontal Health and Oral Microbiome Dynamics Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2021; 11(MAR 10); 6026432021 Najmanová L.Sabová L.Lenartová M.Janatová T.Myšák J.Větrovský T.Těšínská B.Balíková Novotná G.Koběrská M.Broukal Z.Dušková J.Podzimek Š.Janata J.Zobrazit další (8) Laboratoř Antibiotické rezistence a mikrobiální metabolomiky10.3389/fcimb.2021.602643
Early successional ectomycorrhizal fungi are more likely to naturalize outside their native range than other ectomycorrhizal fungi New Phytologist. 2020; 227(5); 1289-12932020 Vlk L.Tedersoo L.Antl T.Větrovský T.Abarenkov K.Pergl J.Albrechtová J.Vosátka M.Baldrian P.Pyšek P.Kohout P.Zobrazit další (6) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/nph.16557
Biotické ohrožení památek zahradního umění: řasy; sinice a invazní rostliny. Kritický katalog k výstavě 2020 Pergl J.Perglová I.Albrechtová J.Antl T.Abarenkov K.Baldrian P.Cihlářová L.Klečka J.Kohout P.Kvasničková J.Maršálek B.Maršálková E.Pejchal M.Petružálková M.Petřík P.Pyšek P.Sádlo J.Štefl L.Tedersoo L.Větrovský T.Vlk L.Vojík M.Vosátka M.Zezulka Š.Zobrazit další (19) Laboratoř environmentální mikrobiologie
Biotické ohrožení památek zahradního umění: řasy; sinice a invazní rostliny 2020 Pergl J.Perglová I.Albrechtová J.Antl T.Abarenkov K.Baldrian P.Cihlářová L.Klečka J.Kohout P.Kvasničková J.Maršálek B.Maršálková E.Pejchal M.Petružálková M.Petřík P.Pyšek P.Sádlo J.Štefl L.Tedersoo L.Větrovský T.Vlk L.Vojík M.Vosátka M.Zezulka Š.Zobrazit další (19) Laboratoř environmentální mikrobiologie
Resolving the taxonomy of emerging zoonotic pathogens in the Trichophyton benhamiae complex Fungal Diversity. 2020; 104(1); 333-3872020 Čmoková A.Kolařík M.Dobiáš R.Hoyer L.Janouškovcová H.Kano R.Kuklová I.Lysková P.Machová L.Maier T.Mallátová N.Man M.Mencl K.Nenoff P.Peano A.Prausová H.Stubbe D.Uhrlass S.Větrovský T.Wiegand C.Hubka V.Zobrazit další (16) Laboratoř genetiky a metabolismu hub10.1007/s13225-020-00465-3
Feeding on fungi: genomic and proteomic analysis of the enzymatic machinery of bacteria decomposing fungal biomass Environmental Microbiology. 2020; 22(11); 4604-46192020 Starke R.Morais D.Větrovský T.López Mondéjar R.Baldrian P.Brabcová V.Zobrazit další (1) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1111/1462-2920.15183
Termites host specific fungal communities that differ from those in their ambient environments Fungal Ecology. 2020; 48(DEC 2020); 1009912020 Větrovský T.Soukup P.Stiblik P.Votýpková K.Chakraborty A.Odriozola Larranga I.Sillam-Dusses D.Lo N.Bourguignon T.Baldrian P.Šobotník J.Kolařík M.Zobrazit další (7) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.funeco.2020.100991
Metagenomics and stable isotope probing reveal the complementary contribution of fungal and bacterial communities in the recycling of dead biomass in forest soil Soil Biology and Biochemistry. 2020; 148(SEP 2020); 1078752020 López Mondéjar R.Tláskal V.Větrovský T.Štursová M.Toscan R.da Rocha U.Baldrian P.Zobrazit další (2) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.soilbio.2020.107875
Alien ectomycorrhizal plants differ in their ability to interact with co-introduced and native ectomycorrhizal fungi in novel sites The ISME Journal. 2020; 14(9); 2336-23462020 Vlk L.Tedersoo L.Antl T.Větrovský T.Abarenkov K.Pergl J.Albrechtová J.Vosátka M.Baldrian P.Pyšek P.Kohout P.Zobrazit další (6) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1038/s41396-020-0692-5
GlobalFungi; a global database of fungal occurrences from high-throughput-sequencing metabarcoding studies Scientific Data. 2020; 7(1); 2282020 Větrovský T.Morais D.Kohout P.Lepinay C.Algora C.Awokunle Hollá S.Bahnmann B.Bílohnědá K.Brabcová V.D'Alo F.Human Z.Jomura M.Kolařík M.Kvasničková J.Lladó S.López Mondéjar R.Martinovič T.Mašínová T.Mészárošová L.Michalčíková L.Michalová T.Mundra S.Navrátilová D.Odriozola Larranga I.Piche-Choquette S.Štursová M.Švec K.Tláskal V.Urbanová M.Vlk L.Voříšková J.Žifčáková L.Baldrian P.Zobrazit další (28) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1038/s41597-020-0567-7
A meta-analysis of global fungal distribution reveals climate-driven patterns Nature Communications. 2019; 10(NOV 13); 51422019 Větrovský T.Kohout P.Kopecký M.Macháč A.Man M.Bahnmann B.Brabcová V.Choi J.Mészárošová L.Human Z.Lepinay C.Lladó S.López Mondéjar R.Martinovič T.Mašínová T.Morais D.Navrátilová D.Odriozola Larranga I.Štursová M.Švec K.Tláskal V.Urbanová M.Wan J.Žifčáková L.Howe A.Ladau J.Peay K.Storch D.Wild J.Baldrian P.Zobrazit další (25) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1038/s41467-019-13164-8
The concept of operational taxonomic units revisited: genomes of bacteria that are regarded as closely related are often highly dissimilar Folia Microbiologica. 2019; 64(1); 19-232019 Lladó S.Větrovský T.Baldrian P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1007/s12223-018-0627-y
Cellulase-Hemicellulase Activities and Bacterial Community Composition of Different Soils from Algerian Ecosystems Microbial Ecology. 2019; 77(3); 713-7252019 Houfani A.Větrovský T.Navarrete O.Štursová M.Tláskal V.Beiko R.Boucherba N.Baldrian P.Benallaoua S.Jorquera M.Zobrazit další (5) Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1007/s00248-018-1251-8
Tracking of the activity of individual bacteria in temperate forest soils shows guild-specific responses to seasonality Soil Biology and Biochemistry. 2019; 135(AUG); 275-2822019 Lladó S.Větrovský T.Baldrian P. Laboratoř environmentální mikrobiologie10.1016/j.soilbio.2019.05.010
Microbial communities in local and transplanted soils along a latitudinal gradient Catena. 2019; 173(February); 456-4642019 Heděnec P.Jílková V.Lin Q.Cajthaml T.Filipová A.Baldrian P.Větrovský T.Krištůfek V.Chroňáková A.Setälä H.Tsiafouli M.Mortimer S.Kukla J.Frouz J.Zobrazit další (9) Laboratoř environmentální biotechnologie10.1016/j.catena.2018.10.043
